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质粒构建-protocol【公众微信号:bioworlde】.docVIP免费

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一,引物设计:1,选择合适的载体。酶切位点及其顺序(酶切位点的顺序一定不能颠倒)。2,在NCBI上再次确认目的片段的碱基序列。1,使用word排除目的片段里含有的酶切位点,最后确定所使用的酶。2,设计引物:primer-up:---------Primer-down:-----------3,核对----送公司合成。4,对公司合成的引物离心,10000rpm、5-10分钟、at4℃,在超净台按照管子上标注的体积加入高压水(2dH2O),再把上游引物和下游引物混在一起,at4℃保存。二,PCR(P出目的片段):(一)、从韩家淮实验室赠送的菌液里P出目的片段:1,揺菌过夜:2ul韩家淮实验室的菌液,Xul相应的抗生素3mlLB94℃5min2,pcr:菌液1ul94℃30sec2xPFUmix25ul58℃30secPrimer1ul72℃Xmin2dH2O23ul72℃5min(X是根据片段的长度设定,500-1000bp/min,退火温度根据Tm值来计算,一般低于Tm值2℃)3,跑胶、回收:(1),配胶:称0.6g的琼脂糖加入60ml的1XTAE加入0.6ul的EB(待温度降到50-60℃左右时)25分钟后,即可点样跑胶。(2),跑胶:130-150V、25-30分钟左右。(3),紫外灯下观察,切胶(要带防护手套和口罩)4,做胶回收(天根{TIANGEN}公司的DNA纯化回收试剂盒):按照试剂盒的protocol来做,在胶回收的最后一步,ElutionBuffer预先在55-65℃温箱中水浴,并且在加过EB后,放在37℃温箱中2min。对胶回收的产物跑胶验证。可建立10ul的体系:回收产物2ul、10xloadingbuffer2ul、2dH2O6ul。三,酶切、链接:1,目的片段酶切:(37℃酶切过夜或者4小时)insert:上述胶回收产物35ul10xHbuffer(1.5x)7ul50ul的体系ddH2O6ul保护碱基4个上游酶切位点首位20个碱基保护碱基4个下游酶切位点末尾20个碱基的反向互补碱基15ml离心管Pcr(50ul)反应体系Pcr温度体系33cycles1%的琼脂糖胶:大块煮沸3次酶11ul酶21ul2,载体酶切:(37℃酶切过夜或者4小时)Vector(1ug/ul):2ul10xbuffer(1.5x)3ul20ul的体系ddH2O13ul酶11ul酶21ul为方便以后使用,载体可以一次性多切点。3,酶切时,首先要核对一下酶的buffer,有时双酶切时两个酶不能共用一种buffer,那么就要先切一端,酶切回收后再用另一酶切另一端,然后再酶切产物回收。4,连接:2xRapidLigation6ulVector0.8ul12ul的体系insert4.5ul(目的是为了多加点insert)T4DNALignase1ul四,转化:{⑴、冰上20分钟-→热激:42℃、90秒-→冰上2分钟⑵、加1mlSOC(或者1mlLB),37℃、180rpm、45分钟。⑶、将上述转化后的菌液加入到100ml的LB中。再按抗生素:...

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