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核糖体蛋白L4基因表达水平与结直肠癌预后相关性.pdfVIP免费

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结勿564·ClinJMedOfficJun,2023临床军医杂志2023年6月第51卷第6期核糖体蛋白L4基因表达水平与结直肠癌预后相关性王琼",张成²,王鑫宇²,张倩",刘洋',柳云恩"1.沈阳医学院树人国际学院,辽宁沈阳110034;2.北部战区总医院普通外科,辽宁沈阳110016[摘要]目的技探讨核糖体蛋白L4(RPL4)在结直肠癌患者中的预后价值及生物学意义。方法从癌症基因组图谱(TC-GA)数据库下载542例结直肠癌患者的转录组数据和417例具有完整的总生存期和生存状态资料患者的临床数据。经lim-ma差异基因分析,比较RPL4在结直肠癌组织和正常组织的表达情况,并采用Kaplan-Meier生存分析,评估RPL4表达与结直肠癌患者预后的关系。采用TISCH数据库在单细胞测序水平上验证RPL4在肿瘤微环境中表达的主要细胞类型。经GSEA富集分析探究RPL4表达水平上调相关的肿瘤特征情况。采用CellMiner数据库中癌NCI-60细胞系抗癌药物测试数据,探讨与RPL4基因相关药物的药物敏感性分析。采用HPA数据库和实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)实验分别对组织中RPL4蛋白和mRNA的表达水平进行验证。结果在TCGA结直肠癌的转录组数据中,结直肠癌组织样本中RPL4的表达水平明显高于正常组织,差异有统计学意义(P<0.001)。经患者配对差异分析发现,结直肠癌组织样本中RPL4的表达水平大多高于正常组织。经Kaplan-Meier生存分析发现,RPL4低表达组的总生存期明显长于高表达组,差异有统计学意义(P<0.05)。在单细胞测序水平分析中,RPL4主要在恶性细胞和大多数免疫细胞高表达,而在上皮细胞几乎不表达。经GSEA富集分析发现,在Hallmark基因集中,主要富集于MYC和氧化磷酸化通路;在KEGG基因集中,主要富集于细胞周期和DNA复制以及氨基酸代谢相关通路,这些通路主要参与调控肿瘤的增殖与分化。药物敏感性分析发现,贝利司他、帕博西尼和小分子XR-11576等8种药物的IC50值在RPL4高表达组中显著降低,差异有统计学意义(P<0.05)。在HPA数据库中,RPL4在结直肠癌组织的蛋白表达水平明显高于正常组织。经实时荧光定量PCR实验验证,在结直肠癌组织中,RPL4的mRNA表达水平明显高于正常组织,差异有统计学意义(P<0.05)。结论核糖体基因RPL4有潜力成为用于结直肠癌诊断和预后评估的新型生物学标志物。[关键词]结直肠癌;预后;核糖体蛋白L4;癌症基因组图谱中图分类号:R735.3doi:10.16680/j.1671-3826.2023.06.05文章编号:1671-3826(2023)06-0564-06CorrelationbetweenthegeneexpressionofribosomeproteinL4andtheprogn...

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