第41卷第1期2023年2月广东医科大学学报JOURNALOFGUANGDONGMEDICALUNIVERSITYVol.41No.1Feb.202316基于生物信息学分析类风湿性关节炎的潜在治疗靶点叶尔柏1，萧晓玲1，张森鹏1，叶芯妮1，何露露1，周玉其1，张维炊1，陈棉海1，王宇霓1，杜以宽2*，杨春1*（1.广东医科大学干细胞与再生组织工程重点实验室，广东东莞523808；2.东莞市人民医院中心实验室，广东东莞523059）摘要：目的生物信息学分析类风湿性关节炎（RA）关键基因及信号通路。方法检索GEO数据库中关于类风湿关节炎的相关芯片GSE77298，构建差异基因蛋白质-蛋白质相互作用关系（PPI），进行GO富集分析和KEGG通路分析，通过AnimalTFDB数据库预测转录因子。结果GSE77298芯片中筛选出1539个差异基因，其中有1156个上调基因和383个下调基因；信号通路主要表现为类风湿性关节炎、金黄色葡萄球菌感染、趋化因子、病毒性心肌炎、细胞因子-细胞因子受体相互作用等；hubgene为CXCL12、CD44和CDH2；hsa-miR-30a-3p、hsa-miR-34a-5p、hsa-miR-30d-3p等10种主要miRNA；预测主要转录因子为GTF3C2、GLYR1、TRIM24、YY1等。结论CXCL8、SOCS3、TLR2等可能是RA关键基因，has-miR-340-5p等10个重要miRNA可能参与RA发病过程，YY1等转录因子可能参与RA的疾病过程。关键词：类风湿关节炎；差异表达基因；生物信息学；基因芯片中图分类号：R593.22；Q811.4文献标志码：A文章编号：2096-3610（2023）01-0016-07Bioinformatics-basedanalysisofpotentialtherapeutictargetsforrheumatoidarthritisYEEr-bai1,XIAOXiao-ling1,ZHANGSen-peng1,YEXin-ni1,HELu-lu1,ZHOUYu-qi1,ZHANGWei-chui1,CHENMian-hai1,WANGYu-mi1,DUYi-kuan2*,YANGChun1*(1.KeyLaboratoryofStemCellandRegenerativeTissueEngineering,GuangdongMedicalUniversity,Dongguan523808,China;2.CentralLaboratoryofDongguanPeople’sHospital,Dongguan523059,China)Abstract:ObjectiveToanalyzethekeygenesandsignalingpathwaysofrheumatoidarthritis(RA)usingbioinformatics.MethodsThechipRA-relatedGSE77298inGEOdatabasewasretrieved,followedbyconstructionofdifferentialgeneprotein-proteininteractionrelationship(PPI),GOenrichmentandKEGGpathwayanalysis.ThetranscriptionfactorswerepredictedbytheAnimalTFDBdatabase.ResultsAtotalof1539differentialgeneswerescreenedinchipGSE77298,including1156up-regulatedand383down-regulatedgenes...
