浙江省第四届大学生生命科学学科竞赛实验记录序号:6实验时间:7月16日—7月18日鲍曼不动杆菌基因组DNA提取【实验目的】1、掌握细菌基因组DNA提取的原理和方法;2、掌握琼脂糖凝胶电泳检测核酸的原理和操作;【实验原理】一、基因组DNA提取:细菌的核酸分为两类:DNA和RNA,DNA主要存在于染色体中,RNA主要存在于细胞质中。因此,制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般过程是经阴离子去污剂结合蛋白酶裂解细菌之后,利用CATB,酚抽提法去除多糖、蛋白质、RNA等杂质,并选择性沉淀得到较纯DNA。提取DNA的反应体系中,SDS(十二烷基硫酸钠)是一种阴离子去污剂,在高温(55-65℃)条件下能裂解细胞,使染色体离析,蛋白变性,释放出核酸;EDTA可抑制细胞中Dnase的活性;苯酚作为蛋白变性剂,同时抑制了DNase的降解作用,反复抽提,使蛋白质变性沉淀于水相和有机相之间。苯酚、氯仿抽提可以彻底去除蛋白质,醇沉淀可以去除盐。对于一般的样品(杂质为蛋白质),该方法完全可以获得高质量的核酸。二、琼脂糖凝胶电泳:琼脂糖凝胶电泳技术(agarosegelelectroghoresis)是分离、鉴定和提纯DNA片断的有效方法。DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时具有电荷效应与分子筛效应。它首先利用琼脂糖凝胶的分子筛效应,将大小不同的片段分离开来;此外,在弱碱性条件下,DNA分子带负电荷,从负极向正极移动。根据DNA分子大小、结构及所带电荷的不同,它们以不同的速率通过介质运动而相互分离。借助溴化乙锭(EB)能与双链DNA结合的作用,利用EB染色,并通过紫外线激发即可观察被分离DNA片段的位置。根据荧光的位置,可区分不同的核酸带。还可判定核酸制品的完整性。基因组DNA片段的分子量很大,在电场中泳动很慢,如果发生降解,电泳图呈拖尾状。【实验材料】1、实验菌株:从××医院临床分离的11株鲍曼不动杆菌B20-B30。2、实验试剂:LB液体培养基、STE缓冲液(0.1mol/LNaCl,10mmol/LTris-HCl,10mmol/LEDTA)、GTE缓冲液(50mmol/L葡萄糖,25mmol/LTris-HCl,10mmol/LEDTA)、TE缓冲液(PH8.0)(10mmol/LTris-HCl,1mmol/LEDTA)、5mol/LNaCl、2%SDS、100mg/mL溶菌酶、10mg/mLRNaseA、Tris-饱和酚(Tris-phenol)、氯仿(chloroform)、无水乙醇(Ethanol)、NormalRunTM1kb-ⅡqDL10002、1×TAE电泳缓冲液、溴化乙锭水溶液(10mg/mL)、上样缓冲液(6×loadingbuffer)。3、实验仪器:安泰超净工作台、指针式...