KEGGPathway的使用方法KEGG(京都基因与基因组百科全书)是基因组破译方面的数据库。在后基因时代一个重大挑战是如何使细胞和有机体在计算机上完整的表达和演绎，让计算机利用基因信息对更高层次和更复杂细胞活动和生物体行为作出计算推测。为达到此目的，人们建立了一个在相关知识基础上的网络推测计算工具。在给出染色体中一套完整的基因的情况下，它可以对蛋白质交互（互动）网络在各种细胞活动起的作用作出预测。KEGG的PATHWAY数据库整合当前在分子互动网络（比如信号通路，复合物）的知识。好了，废话不多说了，开始教大家如何使用KEGG的Pathway来找已知通路。首先打开网页：http://www.genome.jp/kegg/找到KEGGPathway，点进去。输入想要了解的分子。举个例子，比如Wnt，点击“GO”我们就来了解一下Wnt相关的通路。可以看到相关的通路有20个之多，我们主要看一下Wnt的经典信号通路，直接点击图片。Wnt通路有三条，Wnt/β-Catenin的经典通路，PCP通路和，Wnt/Ca2+通路。是不是有点看不懂，这些尖头虚线代表啥呢？特意给大家翻译了一下图例，不谢！简单实战解释一下经典Wnt通路的主线哈。Wnt通过Frizzled/LRP5/6复合体，将信号传递给了DVL（Dsh，Dishevelled）；DVL抑制了GSK-3β/Axin/APC/β-Catenin复合物的形成，而在这个复合体内，GSK-3β通过磷酸化β-Catenin来起到抑制β-Catenin的作用；复合体内的β-Catenin被磷酸化后，会间接地被泛素化而后降解；β-Catenin如果没有被磷酸化抑制，就可以穿过膜，促进转录因子TCF/LEF对下游基因（c-myc，cycD等）的促进转录表达，影响到细胞周期通路。通路图上所有的基因都是可以点击进去的。比如点击β-Catenin，即可得到与之相关的其他通路信息。通路与通路间的关系，也会渐渐展开的。大家有兴趣的话，还是实践操作一下会比较好，好了，就策到这里了。
