-106-遗传育种·GeneticsandBreeding2023年第59卷第08期广西巴马小型猪NLRP6基因的克隆、生物信息学及组织表达分析江山，张帅，张坤，许迪，颜港，邢天琦，王钰滨，王梦影，兰干球*，梁晶*（广西大学动物科学技术学院，广西南宁530004）摘要：为探究NLRFamilyPyrinDomainContaining6（NLRP6）在广西巴马小型猪的蛋白结构和组织表达水平，本实验以巴马小型猪为材料，通过克隆获取了NLRP6的CDS序列全长，并进行生物信息学和组织表达谱分析，同时采用qRT-PCR分析NLRP6基因在不同组织的表达分布情况。结果显示，NLRP6基因的CDS序列全长为2640bp，编码879个氨基酸。生物信息学分析表明，NLRP6蛋白分子式预测为C4294H6958N1234O1272S37，等电点为8.12，为亲水性碱性蛋白质。经氨基酸序列比对和物种进化树分析发现，广西巴马小型猪NLRP6基因与猪的遗传距离最近，其次是牛，与小鼠的遗传距离最远。qRT-PCR结果表明，NLRP6基因在肾脏组织表达最高，同时在小肠部位具有很高的表达水平，但在心脏和肌肉组织中表达量极低。本研究结果为进一步研究猪NLRP6基因提供了理论参考。关键词：NLRP6基因；抗菌功能；肠道中图分类号：S828文献标识码：ADOI编号：10.19556/j.0258-7033.20221101-04我国是养殖大国，生猪养殖作为民族产业，有力地维持着国民经济的正常运转[1]。2020年以来，国家大力推行畜禽饲料禁止添加抗生素的政策，我国的畜禽业迈入了绿色发展的高速通道[2]。肠道健康一直是生猪产业发展的焦点，通过人为营养调控的方法，能够改善肠道菌群结构和免疫功能，增强消化肠道维持微生态平衡的能力，以此提高肠道的消化吸收效率，有效地提高了生产性能和减少肠胃疾病的发生[3]。猪的胃肠道定居着多种肠道菌群，它们参与体内的代谢调控，对成长阶段的猪在健康方面发挥着举足轻重的作用[4-5]。NLRP6最早由Grenier等[6]提出，NLRP6炎症小体广泛分布在肠道组织，可识别检测到多种来自肠道内部的危险信号，与众多下游信号通路关联，进而调控肠道的黏膜结构和微生态平衡[7]。寻找新型抗生素替代物是当今养殖生产刻不容缓的话题，抗菌肽以其独有的抗菌功能和耐药性引起了大家的广泛关注。目前关于NLRP6基因的研究主要集中在人类医学上，动物生产上的相关研究较少[8-9]。广西巴马小型猪作为广西地区的地方品种，毛色亮丽，肉质鲜美，具有广阔的市场前景。本研究通过对广西巴马小型猪NLRP6基因进行克隆，并进行生物信息学分析，对该基因在猪的不同组织表达情况进行分析，...
