研究报告ResearchReport面包果DNA条形码筛选与遗传多样性分析高效梅1,2伍宝朵1胡丽松1,3谭乐和1,3吴刚1,3*1中国热带农业科学院香料饮料研究所,万宁,571533;2云南农业大学热带作物学院,普洱,665000;3中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,国家热带植物种质资源库,海口,570100*通信作者,wugang6170@163.com摘要本研究以30份面包果资源为研究对象，对ITS、g3pdh、marK、trnL-F和rbcL5种DNA条形码序列进行扩增测序分析，通过多序列比对分析序列特征。利用筛选出的理想DNA条形码序列进行遗传距离分析，构建NJ邻接系统进化树。结果表明，g3pdh和ITS序列变异位点较多，变异没有规律性；matK和rbcL序列保守，变异位点少且集中于某些种质；trnL-F序列较保守，部分变异可作为识别特征。基于trnL-F序列分析面包果资源遗传距离为0~0.033，平均遗传距离为0.010。基于系统发育树结果，可将面包果资源聚为4个分支，推测XYS1-3、XYS1和YBG可能引种于印度尼西亚，XYS2、XYS3、XYS5和XYS6可能引种于越南、泰国等东南亚地区。综上所述，trnL-F序列更适合用于面包果遗传多样性分析，可用于部分种质的鉴别。关键词面包果;DNA条形码;trnL-F序列;序列特征分析;系统发育树DNABarcodeScreeningandGeneticDiversityAnalysisofBreadfruitGaoXiaomei1,2WuBaoduo1HuLisong1,3TanLehe1,3WuGang1,3*1SpiceandBeverageResearchInstitute,ChineseAcademyofTropicalAgriculturalSciences,Wanning,571533;2CollegeofTropicalCropScience,YunnanAgriculturalUniversity,Puer,665000;3NationalTropicalPlantsGermplasmResourceCenter,TropicalCropsGeneticResourcesInstitute,ChineseAcademyofTropicalAgricultureSciences,Haikou,570100*Correspondingauthor,wugang6170@163.comDOI:10.13271/j.mpb.021.004719AbstractInthisstudy,thirtybreadfruitresourceswereusedasthematerials.FiveDNAbarcodingsforITS,g3pdh,marK,trnL-FandrbcLweresequencedandanalyzedthesequencecharacteristicsthroughmultiplesequencealignment.Theneighborjoining(NJ)methodswasusedtoconstructphylogenetictreesandKimuratwo-parameter(K2-P)modelwasusedtocalculatethegeneticdistanceofdifferentresources.Theresultsshowedthattheg3pdhandITSsequenceshadmanyvariationsiteswithoutregularity,andthematKandrbcLsequenceshadfewvariationsitesandconcentratedinsomegermplasms.Inaddition,trnl-Fse...
