山东医药2023年第63卷第3期多发性骨髓瘤/浆细胞白血病差异表达基因生物学功能、关键基因表达水平及其与预后的关系常慧娟,孟夜,朱玉榕,班燕芳,章建国,王芝涛,秦慧安徽医科大学第二附属医院,合肥230601摘要:目的筛选出多发性骨髓瘤(MM)与浆细胞白血病(PCL)之间的差异表达基因,了解其生物学功能,明确关键基因表达水平与MM预后的关系。方法从公共基因芯片数据库(GEO)中下载MM与PCL芯片数据集GSE66291和GSE70323,在R软件中用Limma包分别筛选差异表达基因(DEGs)并取交集。利用基因本体(GO)以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析对DEGs进行功能和通路注释,使用Sring对交集的DEGs构建蛋白质—蛋白质互作网络(PPI),筛选关键基因,使用Cytohubba插件筛选相关度前20位的关键基因,最后在GSE24080中根据关键基因的表达水平将MM患者分为高表达组及低表达组,比较高低表达组的总体生存率。结果共获取DEGs389个,120个上调,269个下调。GO分析结果显示:在细胞组分方面主要与细胞膜外区域相关;在生物过程方面,参与白细胞游走、中性粒细胞聚集、体液免疫等;分子功能方面,主要与抗原结合相关。KEGG结果提示DEGs在细胞黏附分子、局灶性黏附等相关通路上富集。筛选出CDH1、CD44等20个关键基因,其中CX⁃CL12、CDH1、RNASE3、LYZ、PPBP、VCAM1、QPCT、PECAM1与MM高表达组MM患者的总体生存率高于低表达组(P均<0.05)。结论MM与PCLD的DEGs中120个上调,269个下调。DEGs主要与细胞膜外区域相关,参与白细胞游走、与抗原结合、调控细胞黏附分子及局灶性黏附等相关通路。CXCL12、CDH1、RNASE3、LYZ、PPBP、VCAM1、QPCT和PECAM1可能是与MM患者预后相关的关键基因,其高表达组MM患者预后较好。关键词:多发性骨髓瘤;浆细胞白血病;差异基因;基因本体功能分析;京都基因与基因组百科全书信号通路分析;预后doi:10.3969/j.issn.1002-266X.2023.03.009中图分类号:R551.3文献标志码:A文章编号:1002-266X(2023)03-0044-04Biologicalfunctionofdifferentiallyexpressedgenes,expressionofcoregenesinmultiplemyeloma/plasmacellleukemiaandtheirrelationshipswiththeprognosisCHANGHuijuan,MENGYe,ZHUYurong,BANYanfang,ZHANGJianguo,WANGZhitao,QINHuiTheSecondHospitalofAnhuiMedicalUniversity,Hefei230601,ChinaAbstract:ObjectiveToscreenthedifferentiallyexpressedgenes(DEGs)betweenmultiplemyeloma(MM)and...