论著皮肤鳞状细胞癌免疫细胞浸润与基因富集分析柳若冰１ꎬ郑德义１ꎬ２ꎬ李伟人１(１.贵州医科大学临床医学院ꎬ贵阳５５００００ꎻ２.贵州省人民医院烧伤整形科ꎬ贵阳５５００００)ＤＯＩ:１０３９６９/ｊｉｓｓｎ１００６￣２０８４２０２４０６０２２通信作者:郑德义ꎬＥｍａｉｌ:ｄｅｙｉｚｈｅｎｇ＠１２６.ｃｏｍ中图分类号:Ｒ３４文献标识码:Ａ文章编号:１００６￣２０８４(２０２４)０６￣０７６１￣０８摘要:目的通过生物信息学方法分析皮肤鳞状细胞癌(ＣＳＣＣ)中免疫细胞浸润相关基因差异表达及其意义ꎮ方法从基因表达数据库(ＧＥＯ)搜索并下载ＣＳＣＣ数据集ꎬ经过检索及筛选得到临床信息ＧＳＥ４５２１６和ＧＳＥ１０８００８两个数据集ꎬ使用Ｒ语言ＣＩＢＥＲＳＯＲＴ函数分析免疫细胞浸润情况ꎬ以及它们在ＣＳＣＣ组和对照组中的差异性ꎮ使用ｖｉｏｐｌｏｔ软件绘制差异细胞的小提琴图ꎬＲ软件ｃｌｕｓｔｅｒＰｒｏｆｉｌｅｒ包对靶基因通过基因本体(ＧＯ)功能注释和基于京都基因与基因组百科全书(ＫＥＧＧ)通路数据库进行信号通路富集分析ꎮ结果与对照组相比ꎬＣＳＣＣ组中３８０个差异表达基因ꎬ其中７６个上调基因、３０４个下调基因ꎬ通过分析差异表达基因筛选排名前１０的关键基因分别为人乳铁蛋白、Ｇ蛋白偶联受体１、ＲＰＴＮ、天冬氨酰氨基葡糖苷酶、ＰＡＮ３、烟酰胺Ｎ￣甲基转移酶、分泌粒蛋白５、叶酸受体３、维甲酸诱导蛋白１４、多肽Ｎ￣乙酰半乳糖氨基转移酶１４ꎻＣＳＣＣ发生发展中导致浆细胞数量增加ꎬＭ１型巨噬细胞数量减少ꎬ记忆性ＣＤ４＋Ｔ细胞为高浸润性ꎬ且细胞溶解活性与嗜酸粒细胞呈正相关(ｒ＝０.５３０ꎬＰ<０.００１)ꎬ而与Ｍ２型巨噬细胞呈显著负相关(ｒ＝－０.５７０ꎬＰ<０.００１)ꎬ影响ＣＳＣＣ预后ꎮＧＯ富集分析显示ꎬ基因功能主要与角质细胞分化、细胞防御、存在于细胞膜或细胞核内的蛋白酶体有关ꎮＫＥＧＧ信号通路富集显示ꎬ差异表达基因主要参与胆固醇代谢、脂肪酸等脂质代谢通路ꎮ结论部分免疫细胞浸润及其相关基因差异表达在ＣＳＣＣ发生过程及其预后中起重要作用ꎬ角质细胞分化、脂质代谢信号通路改变可能与ＣＳＣＣ的发病机制密切相关ꎮ关键词:皮肤鳞状细胞癌ꎻ免疫细胞浸润ꎻ差异表达基因ꎻＧＥＯ数据库ꎻ生物信息分析ＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＩｍｍｕｎｅＣｅｌｌＩｎｆｉｌｔｒａｔｉｏｎａｎｄＧｅｎｅＥｎｒｉｃｈｍｅｎｔｉｎＣｕｔａｎｅｏｕｓＳｑｕａｍｏｕｓＣｅｌ...
