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基于公共数据库分析FOXM1在软组织肉瘤中的表达及临床预后意义.pdfVIP免费

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生物信息学第37卷第1期医学信息Vol.37No.12024年1月JournalofMedicalInformationJan.2024基金项目:1.甘肃省自然科学基金(编号:21JR11RA108);2.甘肃省教育厅高等学校创新基金项目(编号:2021B-049);3.兰州大学第二医院“萃英科技创新”计划(编号:2020QN-02);4.兰州大学第二临床医学院“萃英学子科研培育”计划(编号:CYXZ2021-20、CYXZ2021-21)作者简介:马靖琳(1985.5-),女,内蒙古包头人,硕士,助理研究员,主要从事骨与软组织肉瘤的基础研究基于公共数据库分析FOXM1在软组织肉瘤中的表达及临床预后意义马靖琳1袁2袁王婷3袁肖红斌3袁王翠芳1袁安丽萍1袁周延峰1渊1.兰州大学第二医院/甘肃省骨关节疾病研究重点实验室袁甘肃兰州730030曰2.兰州理工大学石油化工学院袁甘肃兰州730050曰3.兰州大学第二临床医学院袁甘肃兰州730030冤摘要院目的分析叉头转录因子M1渊FOXM1冤在软组织肉瘤渊STSs冤中的表达及临床预后价值遥方法通过Oncomine数据库分析FOXM1在常见恶性肿瘤尤其是STSs中的表达水平袁随后在TCGA数据库中进行验证曰在CCLE数据库分析FOXM1在STSs细胞系中的表达水平袁在UALCAN数据库中分析STSs中FOXM1表达与性别尧种族及年龄分组的差异曰通过GEPIA数据库分析FOXM1与STSs患者预后的关系袁及其与PI3K/AKT信号通路关键分子在STSs中的表达相关性曰在STRING数据库分析FOXM1互作蛋白的相互作用网络遥应用在线数据库DAVID对FOXM1及互作基因进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析遥结果Oncomine数据库中共9项涉及STSs组织和对应癌旁组织中FOXM1表达的研究袁并且FOXM1在STSs中均呈高表达渊约0.05冤袁TCGA数据库的验证结果与Oncomine数据库挖掘结果一致遥FOXM1在STSs细胞中呈普遍高表达渊约0.05冤袁且FOXM1的表达水平与性别相关袁与种族尧年龄无关遥GEPIA数据库分析显示袁FOXM1低表达患者的总生存期渊OS冤和无疾病生存期渊DFS冤均高于高表达者渊约0.05冤曰在STSs组织中FOXM1的表达水平与磷脂酰肌醇3-激酶催化亚基琢渊PIK3CA冤尧AKT1及哺乳动物雷帕霉素靶蛋白渊mTOR冤的表达水平均呈正相关渊=0.26尧0.43尧=0.42冤遥蛋白相互作用网络分析发现袁CCNB1尧PLK1尧CDK1尧CCNA2尧MYBL2尧CCNB2尧CENPF尧CDK2尧CDC25A尧CDC20等蛋白与FOXM1具有明显相互作用遥GO富集分析显示袁这些基因涉及的生物学功能包括细胞分裂与细胞周期调控等遥KEGG富集分析显示袁这些基因主要参与的信号通路包括p53信号通路尧FOXO信号通路及PI3K-Akt信号通路等遥结论FOXM1在软...

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