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1/8mRNA的分离纯化【实验原理】真核生物的mRNA分子是单顺反子,是编码蛋白质的基因转录产物。真核生物的所有蛋白质归根到底都是mRNA的翻译产物,因此,高质量mRNA的分离纯化是克隆基因、提高cDNA文库构建效率的决定性因素。哺乳动物平均每个细胞含有约1x10-5gRNA,理论上认为每克细胞可分离出5~10mgRNA。其中rRNA为75%~85%,tRNA占10%~16%,而mRNA仅占1%~5%,并且mRNA分子种类繁多,分子量大小不均一,表达丰度也不一样。真核生物mRNA有特征性的结构,即具有5’端帽子结构(m7G)和3’端的poly(A)尾巴——绝大多数哺乳动物细胞的3’端存在20~300个腺苷酸组成的poly(A)尾,通常用poly(A+)表示,这种结构为真核mRNA分子的提取、纯化,提供了极为方便的选择性标志,寡聚(dT)纤维素或寡聚(U)琼脂糖亲合层析分离纯化mRNA的理论基础就在于此。一般mRNA分离纯化的原理就是根据mRNA3’末端含有多poly(A)尾巴结构特性设计的。当总RNA流经寡聚(dT)(即oligo(dT))纤维素柱时,在高盐缓冲液作用下,mRNA被特异地吸附在oligo(dT)纤维素柱上,在低盐浓度或蒸馏水中,mRNA可被洗下,经过两次oligo(dT)纤维素柱,即可得到较纯的mRNA。目前常用的mRNA的纯化方法有:(1)寡聚(dT)-纤维素柱层析法,即分离mRNA的标准方法;(2)寡聚(dT)-纤维素液相离心法,即用寡聚(dT)-纤维素直接加入到总的RNA溶液中并使mRNA与寡聚(dT)-纤维素结合,离心收集寡聚(dT)-纤维素/mRNA复合物,再用洗脱液分离mRNA,然后离心除去寡聚(dT)-纤维素;2/8(3)其它一些方法:如寡聚(dT)-磁性球珠法等。本实验应用方法(1)进行mRNA的分离纯化。【试剂与器材】(一)试剂1.0.1mol/LNaOH,每组200mL2.寡聚Oligo(dT)-纤维素3.加样/洗涤缓冲液1:0.5mol/LNaCl,20mmol/LTris-HCl(pH7.6),每组250mL或0.5mol/LNaCl,20mmol/LTris-HCl(pH7.6),1mmol/LEDTA(pH8.0),0.1%SDS。4.洗涤缓冲液2:0.1mol/LNaCl,20mmol/LTris-HCl(pH7.6),每组250mL或10mmol/LTris-HCl(pH7.6),1mmol/LEDTA(pH8.0),0.05%SDS。配制时可先配制Tris-HCl(pH7.6)、NaCl、EDTA(pH8.0)的母液,经高压消毒后按各成分确切含量,经混合后再高压消毒,冷却至65℃时,加入经65℃温育(30min)的10%SDS至终浓度。5.5mol/LNaCl,每组10mL6.3mol/LNaAcpH5.2,每组10mL7.无RNase双蒸水(DEPC水),每组100mL8.70%乙醇,每组10mL注意:溶液5,6的配制都应该加0.1%DEPC处理过夜,溶液1,3,4...

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