Hereditas(Beijing)2024年3月,46(3):181―182www.chinagene.cn编委推荐CellStemCell|从人类诱导多能干细胞生成无转基因的造血干细胞造血干细胞(hematopoieticstemcells，HSCs)是终身治疗性造血细胞移植的关键细胞。近几十年来，对临床级别的HSCs需求显著增加，治疗患者面临重大困难。一个有希望但尚未实现的目标是从多能干细胞中生成HSCs。法国EFS细胞工程与治疗中心ThierryJaffredo和索邦大学LaurenceGuyonneau-Harmand课题组合作通过使用一种原创的、符合GMP标准的单步培养系统，成功地从人诱导多能干细胞(humaninducedpluripotentstemcells，hiPSCs)分化出无载体和基质的可移植HSCs(2023年12月7日发表，doi:10.1016/j.stem.2023.11.002)。注射到免疫缺陷小鼠体内后，hiPSCs衍生的细胞定居在骨髓中，形成强大的多系造血细胞群，并具有可连续移植性。scRNA-seq显示，这种造血重建能力是由与人类胚胎主动脉-性腺-中肾(aorta-gonad-mesonephros，AGM)来源HSCs具有相似转录特性的造血群产生。这种无基因转导和无饲养层的工具可能为未来的临床应用铺平道路，为开发遗传性血液恶性肿瘤的治疗靶点提供了新的模型。该系统还可以更好地帮助理解人类胚胎中造血发育程序，因为它可以克服人类胚胎研究的伦理约束。■推荐人：张文清NatureCommunications|运用HiDENSEC计算框架解析Hi-C数据来追踪黑色素瘤演化过程中的结构变异癌症的演化常常伴随着频繁的基因组结构变异，并与药物响应、靶向治疗等临床预后相关。因此，有效鉴定并评估实体瘤中的结构变异十分必要。然而，传统方法例如基于拷贝数的推断和核型鉴定，在处理异质性的实体瘤样本方面均存在局限性。Hi-C技术直接捕获染色体互作信息，在鉴定大尺度染色体重排事件方面具有优势；但已发表的利用Hi-C数据鉴定结构变异的方法例如EagleC和HiC-breakfinder等并未考虑实体瘤的纯度与遗传异质性问题。2023年11月6日，美国加利福尼亚大学伯克利分校分子与细胞生物学系DirkHockemeyer团队在NatureCommunications上发表了题为“TracingcancerevolutionandheterogeneityusingHi-C”的论文(doi:10.1038/s41467-023-42651-2)。该团队构建了用于实体瘤Hi-C数据分析的新计算框架HiDENSEC，首次同时满足了在异质性实体瘤样本中精确推断体细胞拷贝数变异、肿瘤样本纯度以及大尺度染色体重排事件的需求。研究首先使用人为混合的癌细胞系与正常细胞系样本的Hi-C数据进行性能验证；随后与已发表的主流算法进行基准化分析比较...
