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解磷真菌产紫青霉菌SW-10全基因组测序及功能分析.pdfVIP免费

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山东农业科学2023ꎬ55(9):1~9ShandongAgriculturalSciencesDOI:10.14083/j.issn.1001-4942.2023.09.001收稿日期:2023-03-19基金项目:山东省自然科学基金青年项目(ZR2020QC108)ꎻ国家自然科学基金青年项目(32201905)ꎻ山东省玉米产业技术体系项目(SAIL-02-06)ꎻ青岛农业大学高层次人才基金项目(663/1119023)作者简介:刘峰(1997—)ꎬ男ꎬ硕士研究生ꎬ主要从事土壤微生物研究ꎮE-mail:liufeng9703@126.com通信作者:孙青(1990—)ꎬ女ꎬ博士ꎬ讲师ꎬ主要从事土壤微生物研究ꎮE-mail:sunqing0208@126.com解磷真菌产紫青霉菌SW-10全基因组测序及功能分析刘峰1ꎬ张培雨1ꎬ姜雯1ꎬ刘树堂2ꎬ孙雪芳1ꎬ赵子铉1ꎬ刘湘1ꎬ孙青1(1.青岛农业大学农学院ꎬ山东青岛266109ꎻ2.青岛农业大学资源与环境学院ꎬ山东青岛266109)摘要:磷是植物生长必需的营养元素之一ꎬ但土壤的固化作用等导致土壤有效磷只占土壤全磷含量的1%~5%ꎮ解磷真菌通过分泌有机酸及磷酸酶等能持续、稳定提高土壤磷素的有效性并促进作物对磷素的吸收ꎮ本课题组前期分离鉴定出一株对难溶性无机磷和有机磷均具有较好解磷效果的产紫青霉菌(Penicilliumpurpurogenum)ꎬ将其命名为SW-10ꎮ本研究采用IlluminaNovaSeq测序平台对菌株SW-10进行全基因组测序ꎬ完成基因组拼装后进行基因预测、功能注释和解磷相关基因分析ꎮ结果表明ꎬ菌株SW-10基因组大小为29.1Mbꎬ总基因序列长度15597887bpꎬ共预测到9195个编码基因ꎬ基因平均长度1696bpꎮ在GO、KEGG和KOG数据库中分别有6608、3878个和8817个基因得到注释ꎻ鉴定出多个与解磷相关的基因ꎬ包括柠檬酸合成酶基因2个、苹果酸脱氢酶基因2个、碱性磷酸酶基因2个、酸性磷酸酶基因7个、植酸酶基因1个和磷酸盐转运蛋白基因2个ꎻ利用hmmscan软件预测出菌株SW-10基因组序列中存在碳水化合物活性酶(CAZyme)基因共计460个ꎬ推测其具有较好的细胞壁水解酶活性ꎮ本研究结果可为后续产紫青霉菌解磷相关基因的挖掘利用及其遗传信息的改良提供相关理论依据ꎬ同时为其它解磷真菌的基因组学研究提供参考信息ꎮ关键词:产紫青霉...

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