NEBmRNA建库protocol一、RNA质检要求:RIN>7;10ng-1ug。二、mRNAisolation,fragmentationandPriming:准备第一链反应缓冲液和随机引物mix(pink)NEBNextFirstStrandSynthesisReactionBuffer(5X)4µl(pink)NEBNextRandomPrimers1µlNuclease-freewater5ulTotalVolume10ulNote:在mRNA分离中,要保持mix在冰上。1.用nuclease-freewater稀释RNA至25ul(新的PCR管),冰上操作。(样品多的情况下,用排管做)。2.分装7.5ulNEBNextOligod(T)beads至一个新的200ulPCR管(排管操作)。3.Add50µlRNABindingBuffer至beads,用枪吸打6次混匀。4.至于磁力架上2min,RT。5.弃上清。6.从磁力架上去下管子。7.重复清洗一遍,step3-6.8.用25ulRNABindingBuffer重悬磁珠,加入step1稀释好的RNA样品,混匀。9.65℃,5min,hold4℃。(PCR仪上操作)10.当温度降到4℃,将样品取出。11.室温静置5min。12.磁力架上2min。13.弃上清。14.从磁力架上取下PCR管。15.Add100ulWashBuffer清洗磁珠,用枪混匀6次。16.磁力架上2min。17.弃上清。18.从磁力架上取下PCR管。19.重复清洗一次,重复step15-18.20.Add25ulTrisBuffer,用枪轻柔混匀6次。21.80℃,2min,hold25℃。(PCR仪上操作)22.当温度降到25℃后,取出样品。23.Add25RNABindingBuffer,用枪轻柔混匀6次。24.室温静置5min。25.磁力架上2min。26.弃上清。27.从磁力架上取下PCR管。28.Add100ulWashBuffer,用枪轻柔混匀6次。29.磁力架上2min。30.弃上清。31.磁力架上取下管子。32.Add100ulTrisBuffer清洗beads,用枪轻柔混匀6次。33.磁力架上2min。34.弃上清。(Caution:上清要弃干净,勿将磁珠吸走。)35.磁力架上取下管子。36.Add7.5ultheFirstStrandSynthesisReactionBufferandRandomPrimermix(2X)preparedatthestartoftheprotocol溶解磁珠。94℃孵育12min。立即将管子至于磁力架上。37.转移5ul上清(纯化的mRNA)至于新的PCR管(PCR单管)。38.置于冰上。39.ProceedtoFirstStrandcDNASynthesis三、FirstStrandcDNASynthesis1.在上一步骤的5ul上清中,加入以下组分:(pink)MurineRNaseInhibitor0.25µl(pink)ProtoScriptIIReverseTranscriptase0.5µlNucleasefreewater4.25µlFinalvolume10µl2.在PCR仪中按以下步骤孵育样品:10minutesat25°C50minutesat42°C15minutesat70°CHoldat4°C3.马上进行secondstrandsynthesisreaction.四、PerformSecondStrandcDNASynthesis1.在上一步骤10ul反应液中加入以下组分:...