染色质免疫共沉淀（ChIP）染色质免疫共沉淀可以：（1）组蛋白修饰酶的抗体作为“生物标记”；（2）转录调控分析；（3）药物开发研究；（4）DNA损失与凋亡分析。1实验方法原理：在保持组蛋白和DNA联合的同时，通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体，染色质被切成很小的片断，并沉淀下来。IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“proreinA”特异性地结合到免疫球蛋白的FC片段的现象活用开发出来的方法。目前多用精制的proreinA预先结合固化在argarose的beads上，使之与含有抗原的溶液及抗体反应后，beads上的proreinA就能吸附抗原达到精制的目的。2实验材料、试剂、仪器耗材：细胞样品甲醛、甘氨酸、PBS、SDS、LysisBuffer、洗脱液、RNaseA、蛋白酶K、omega胶回收试剂盒等离心管、超声仪、电泳仪、离心机等3实验步骤：一、细胞的甲醛交联与超声破碎（第一天）1.取出1平皿细胞（10cm平皿），加入243ul37%甲醛，使得甲醛的终浓度为1%（培养基共有9ml）。2.37℃孵育10min。3.终止交联：加甘氨酸至终浓度为0.125M。450ul2.5M甘氨酸于平皿中。混匀后，在室温下放置5min即可。4.吸尽培养基，用冰冷的PBS清洗细胞2次。5.细胞刮刀收集细胞于15ml离心管中（PBS依次为5ml，3ml和3ml）。预冷后2000rpm5min收集细胞。6.倒去上清。按照细胞量，加入SDSLysisBuffer。使得细胞终浓度为每200ul含2×106个细胞。这样每100ul溶液含1×106个细胞。再加入蛋白酶抑制剂复合物。假设MCF7长满板为5×106个细胞。本次细胞长得约为80%。即为4×106个细胞。因此每管加入400ulSDSLysisBuffer。将2管混在一起，共800ul。7.超声破碎：VCX750，25%功率，4.5s冲击，9s间隙。共14次。二、除杂及抗体哺育（第一天）1.超声破碎结束后，10000g4℃离心10min。去除不溶物质。2.留取300ul做实验，其余保存于-80℃。3.300ul中，100ul加抗体做为实验组；100ul不加抗体做为对照组；100ul加入4ul5MNaCl（NaCl终浓度为0.2M），65℃处理3h解交联，跑电泳，检测超声破碎的效果。4.在100ul的超声破碎产物中，加入900ulChIPDilutionBuffer和20ul的50×PIC。再各加入60ulProteinAAgarose/SalmonSpermDNA。4℃颠转混匀1h。5.1h后，在4℃静置10min沉淀，700rpm离心1min。6.取上清。各留取20ul做为input。一管中加入1ul抗体，另一管中则不加抗体。4℃颠转过夜。三、检验超声破碎的效果（第一天）1.取100ul超声破碎后产物，加入4ul5MNaCl，65℃处理2h解交联。2.分出一半用酚/氯仿抽...
