解螺旋陪伴医生科研成长http://www.helixlife.cn1过表达载体构建(GOF)基因的过表达视频介绍,请见解螺旋在线视频课程酸谈实验室之基因表达操作篇1.实验原理过表达载体的构建是一个利用切、接、转、增、检等基因工程手段,将外源基因片段插入表达载体的过程。构建前期的设计过程至关重要,包括目的基因序列的确定、载体的选择、酶切位点选择、引物设计等。用限制酶分别切割目的基因两侧及运载体,然后在DNA连接酶的作用下就形成了基因表达载体。2.实验目的从293细胞cDNA中将目的基因通过PCR扩增和酶切连接构建到病毒载体pCDH-myc-GFP/Puro中。解螺旋http://www.helixlife.cn/3.实验材料3.1.主要试剂LB培养基、Amp或Kana抗生素、50%甘油等。3.2.主要仪器LB平板、1.5mLEP管、10mLEP管、枪头等。4.实验步骤实验步骤包括:引物设计,PCR扩增,酶切,连接、转化,克隆鉴定,测序,质粒小抽,质粒入库等。4.1引物设计4.1.1目的基因序列的确定A.根据NM号查询根据NM号查询基因序列最为简单方便,一个NM号对应一个序列,因此在NCBI中输入NM号查询,然后选择相对应CDS序列即可。解螺旋陪伴医生科研成长http://www.helixlife.cn2B.根据基因名称查询根据名称查询较为不便,因为同一个基因可能有多种剪切异构体,因此需要根据实际情况选择、找出目的基因序列。C.片段内部酶切位点分析将目的基因序列输入序列分析软件,分析内部酶切位点。注意:翻译起始密码子ATG和终止密码子(TAA、TAG、TGA)ATG:如果目的基因前(载体上)没有共表达的序列,则必须在基因序列前加ATG;这种情况多见于剪切异构体的构建中。终止密码子:如果目的基因后没有继续表达的序列,则必须加入终止密码子,选择该基因在该物种中自带的终止密码子即可;如果目的基因后连接其他需要表达的序列,则需要去掉终止密码子。4.1.2载体选择根据构建要求选择,选择合适的载体,主要考虑如下几个方面:A.载体类型载体可分为克隆载体、表达载体,后者又有真核表达载体和原核表达载体之分。依据实验目的选择相应载体(见附件)。解螺旋http://www.helixlife.cn/B.载体原件查看载体上的各类原件是否满足实验要求或与要求冲突,例如标签,启动子类型、多克隆位点等。常用启动子III型启动子(H1、U6等)具有表达效率高、有效的确定终止位置等优点,成为首选;II型启动子适用于pri-miRNA序列中有连续的5个T-导致III型启动子(CMV、Ubi等)终止转录的情况。常用蛋白标签Flag:GATTACAAGGATGACGACGATAAGDYKD...