RT-PCRRT-PCR,反转录聚合酶链式反应,是将RNA的反转录和cDNA的聚合酶链式扩增相结合的技术。提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用OligodT或随机引物经过反转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,从而获得目的基因或检测基因表达。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。实验前准备在开始实验前,需准备好实验所用的试剂,如0.1%DEPC溶液,Trizol,氯仿,异丙醇,DEPC水配制的75%乙醇,无RNase-free的纯水,反转录试剂盒、dNTPmix,Taq酶,buffer、凝胶电泳缓冲液等。本次实验所涉及到的仪器和耗材有:ThermoScientific全波长扫描式多功能读数仪,ThermoScientificArktikPCR仪以及F1系列单道移液器和QSP盒装吸头。冷冻离心机,水平电泳槽,电泳仪,离心管,PCR管。首先提取正常小鼠和肝癌小鼠模型的肝脏总RNA,检测其浓度后进行反转录获得cDNA。再以cDNA为模板,通过PCR反应扩增获得大量的p53基因。引物设计本实验使用Oligo6软件设计p53引物。首先登陆NCBI,输入p53的登陆号M13874,获得其CDS等详细信息。复制序列,保存为.seq格式。打开Oligo6软件,打开刚保存的文件,出现Tm、Frq和ΔG窗口。点击Search,选择PrimersandProbes,出现SearchforPrimersandProbes窗口。在该窗口内点击SearchRanges,设置引物搜索范围,上游引物:1-53bp;下游引物:1200-1302bp,产物长度为1000-1200bp,点击ok。点击Parameters,进行更多参数的设置,无特殊需要,可默认,确定完成,开始搜索。在新出现的SearchStatus窗口点击ok可见搜索结果。点击任意一对引物,可在PCR窗口中查看引物的信息。根据GC含量和Tm值,确定比较适合的引物,并保存序列。总RNA提取在装有新鲜动物肝脏组织匀浆中加入相应体积的预冷Trizol,每50-100ng样品加1mlTrizol,充分混匀。静置10min,12000rpm,4°C离心15min。再加入1/5Trizol体积的氯仿,用力颠倒混匀,室温放置3min,可见分层,如此重复几次使液体充分分层。12000×g,4°C离心15min。离心后,溶液分为有机相和水相,中间有一层蛋白质层,RNA在上层水相层。小心地吸取上清,移入新的离心管中。加入1/2Trizol体积的预冷的异丙醇,混匀后室温静置10min。12000×g,4°C离心10min后,可见沉淀。小心地彻底弃上清。将离心管置于离心机中离心数秒,再用移液器小心吸去残留液体。加入1倍Trizol体积的75%乙醇,来回颠倒混匀,使沉淀悬浮...