实验十二、细菌总DNA提取、凝胶电泳检测基本概念:总DNA(totalDNA,genomicDNA)凝胶电泳[实验目的]1.学习细菌总DNA提取的原理和方法2.学习琼脂糖凝胶电泳方法[实验材料]1.菌种自己分离纯化后的细菌菌株2.试剂TE、溶菌酶溶液(20mg/ml)、10%SDS、蛋白酶K(20mg/ml)、5mol/LNaCl酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)、乙醇3.仪器高速台式离心机、紫外检测仪4.其他材料:离心管、无菌吸头、移液器等[实验步骤和过程](一)细菌总DNAD提取革兰氏阳性菌DNA提取方法(提取基因组DNA)1.3-6ml细菌过夜培养液,5000rpm离心10分钟,弃上清2.加0.5mlTE悬浮沉淀,并加75μl溶菌酶(20mg/ml)溶液,40°C保温30分钟3.加50μl,10%SDS,5μl蛋白酶K(20mg/ml),混匀,37℃保温30分钟4.加0.75ml,5mol/LNaCl,混匀5.用等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提,5000rpm离心10分钟,将上清液移至干净离心管6.用等体积氯仿:异戊醇(24:1)抽提,静置10分钟,5000转离心10分钟,转移上清到干净管中。7.加2倍体积乙醇沉淀DNA,颠倒混合,室温下静止10分钟,离心沉淀DNA8.70%乙醇漂洗DNA后,吸干,用30-50μlTE溶解DNA,-20℃保存革兰氏阴性菌总DNA提取方法方法一:1.将菌液悬于1.5ml溶菌酶溶液(0.15mol/lNacl,0.1mol/lNa2EDTA,15mg/ml溶菌酶,pH=8).2.37℃温浴2h,3.加入1.5ml10%SDS(0.1mol/lNacl,0.5mol/lTris,10%SDS,pH=8)反复颠倒混匀10min,10000r/min离心10min,取上清4.用等体积苯酚:氯仿:异戊醇各抽提1次,水相中加入40μl的3mol/l乙酸铵和3ml无水乙醇,-20℃沉淀DNA1h,12000r/min离心10min5.收集DNA沉淀,用100μlTE溶解方法二:1.加入DNA提取液100mmol/l,(Tris100mmol/lEDTA,100mmol/lNacl,1%pvp,2%SDS,pH=8)旋涡混匀2.在摇床上250r/min振荡2h,4℃沉淀DNA1h,13000r/min离心10min收集DNA沉淀3.用100μlTE溶解DNA方法三:1.加入DNA提取液(100mmol/l,Tris100mmol/lEDTA,100mmol/l磷酸钠,1.5mol/lNacl,1%CTAB,pH=8),20μl蛋白酶K(20mg/ml)和500μl溶菌酶(0.15mol/lNacl,0.1mol/lNa2EDTA,15mg/ml溶菌酶,pH=8),37℃温浴2h。2.加入1ml20%SDS,65℃水浴过夜3.加入1/3倍体积饱和Nacl,剧烈振荡,12000r/min离心10min4.取上清,用等体积苯酚:氯仿:异戊醇各抽提1次,水相中加入等体积TE,再加入0.6倍体积的异丙醇室温沉淀DNA2h5.12000r/min离心10min收集DNA沉淀,用200μlTE溶解方法四:1.取20μlTE、20μl饱和酚与无菌小离心管中2.取已经培养好的菌一环到上述离心管中3....