分子植物育种，2023年，第21卷，第3期，第764-771页MolecularPlantBreeding,2023,Vol.21,No.3,764-771研究报告ResearchReport刺梨RrCCoAOMT基因家族的鉴定与生物信息学分析卢晨1,2张小英1,2鲁敏1张藉粱1安华明1,2*1贵州大学农学院,贵阳,550025;2贵州大学,国家林业和草原局刺梨工程技术研究中心,贵阳,550025*通信作者,hman@gzu.edu.com摘要咖啡酰辅酶A氧甲基转移酶(caffroyl-CoAO-methyltransferase,CCoAOMT)是一类S-腺苷-L-甲硫氨酸(SAM)甲基转移酶，本研究采用生物信息学方法，旨在鉴定和注释刺梨中CCoAOMT家族基因的全基因组序列，分析RrCCoAOMT基因的分布，同时分析RrCCoAOMT基因结构与其启动子顺式调控元件。结果表明，刺梨中预测具有3个CCoAOMT基因，氨基酸的长度范围为180~245，分子量范围为20496.53~27815.17kD，等电点为4.70~6.14。蛋白质二级结构预测结果表明RrCCoAOMT家族蛋白主要以α-螺旋和不规则卷曲为主。本研究对CDS上游2kb启动子区域的顺式元件分析表明，光是影响该家族功能的重要因素。亚细胞定位预测表明RrCCoAOMT家族蛋白主要定位于细胞质中，其中仅CCoAOMT01定位到细胞骨架上，预测其与木质素的合成最相关。RT-qPCR结果表明：经遮阴处理后，CCoAOMT01的基因表达量逐渐下降，而外源Ca2+处理则上调CCoAOMT01的表达；经ETH及SA处理后，CCoAOMT01的基因表达量表达模式为先下降，后上升。以上结果为进一步研究刺梨CCoAOMT参与木质素合成机制提供了理论参考。关键词刺梨;CCoAOMT;木质素;生物信息学分析IdentificationandBioinformaticsAnalysisofRrCCoAOMTGeneFamilyinRosaroxburghiiLuChen1,2ZhangXiaoying1,2LuMin1ZhangJiliang1AnHuaming1,2*1SchoolofAgriculture,GuizhouUniversity,Guiyang,550025;2NationalForestryandPrairieBureauRosaRoxbunghiiEngineeringTechnologyRe-searchCenter,GuizhouUniversity,Guiyang,550025*Correspondingauthor,hman@gzu.edu.comDOI:10.13271/j.mpb.021.000764AbstractCaffeoyl-CoAO-methyltransferase(CCoAOMT)isakindofS-adenosine-L-methionine(SAM)methyl-transferase.Inthisstudy,bioinformaticsmethodswereusedtoidentifyandannotatethewholegenomesequenceofCCoAOMTfamilygenesinRosaroxburghii,analyzethedistributionofRrCCoAOMTgenes,andanalyzethegenestructureofRrCCoAOMTanditspromotercis-regulatoryelements.TheresultsshowedthattherewerethreeCCoAOMTgenespredictedinRosaroxb...
