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大连市2020年甲型肝炎病毒流行株基因特征_杨月.pdfVIP免费

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大连市2020年甲型肝炎病毒流行株基因特征杨月1,朱琳1,杨芳2,韩一楠1,尹文娇3,4,曹经瑗3,4,毕胜利3,4(1.大连市疾病预防控制中心,辽宁大连116021;2.庄河市疾病预防控制中心,辽宁庄河116400;3.国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室,北京102206;4.中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,北京102206)DOI:10.19914/j.CJVI.2023009通信作者:韩一楠,Email:hanyinan@hotmail.com;尹文娇,Email:yinwj_cdc@126.com第一作者Email:yangyue83921@163.com摘要:目的分析大连市甲型肝炎(甲肝)病毒(HepatitisAvirus,HAV)流行株基因特征。方法采集大连市2020年部分甲肝病例急性期血清或粪便标本,提取HAV核酸,采用巢式RT-PCR扩增目的基因,构建HAV获得序列与GenBank中参考序列的系统进化树,分析HAV序列VP1-2A区核苷酸和氨基酸同源性,确定基因型。结果从甲肝病例标本中获得54条HAV序列,核苷酸、氨基酸同源性分别为97.15%-100%、98.13%-100%,属于ⅠA基因亚型。获得序列与中国大陆序列中2014年辽宁省丹东市、2019-2020年山东省烟台市和威海市序列的核苷酸同源性最高,为98.42%-99.69%;与其他国家序列中日本、意大利HAV序列的核苷酸同源性最高,为99.07%-100%。在获得序列中,53条序列的氨基酸同源性为100%,1条序列与其存在2个氨基酸差异。结论大连市2020年HAV优势流行株为ⅠA基因亚型,甲肝可能具有多个传播链和相同感染来源。HAV基因型监测有助于HAV溯源和及时采取应对措施。关键词:甲型肝炎;甲型肝炎病毒;基因型;同源性中图分类号:R183.4文献标识码:A文章编号:1006-916X(2023)01-0047-06GeneticcharacteristicsofhepatitisAvirusstrainscirculatinginDalian,2020YangYue1,ZhuLin1,YangFang2,HanYinan1,YinWenjiao3,4,CaoJingyuan3,4,BiShengli3,4(1.DalianMunicipalCenterforDiseaseControlandPrevention,Dalian116021,Liaoning,China;2.ZhuangheMunicipalCenterforDiseaseControlandPrevention,Zhuanghe116400,Liaoning,China;3.NationalHealthCommissionKeyLaboratoryofMedicalVirologyandViralDiseases,Beijing102206,China;4.NationalInstituteforViralDiseaseControlandPrevention,ChineseCenterforDiseaseControlandPrevention,Beijing102206,China)Abstract:ObjectiveTodeterminegeneticcharacteristicsofhepatitisAvirus(HAV)strainscirculatinginDaliancity.MethodsWecollecteds...

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