分子植物育种，2023年，第21卷，第3期，第717-728页MolecularPlantBreeding,2023,Vol.21,No.3,717-728研究报告ResearchReport大豆SPL基因家族生物信息学分析王文丽1,2董英山2刘晓冬2王玉民2赵洪锟2袁翠平2齐广勋2王英男2郑梅竹1*李玉秋2*1长春师范大学生命科学学院,长春,130032;2吉林省农业科学院大豆研究所,长春,130033*共同通信作者,zhengmeizhu2008@126.com;lyqhb1@126.com摘要SQUAMOSA启动子结合蛋白样(SPL)转录因子广泛存在于植物中，主要参与植物生长、发育以及多种生理生化过程。为明确大豆SPL基因家族在染色体上的分布、保守结构域、亚族种类、进化关系等，采用生物信息学方法对大豆SPL家族基因进行分析。本研究从大豆基因组数据库中筛选得到43个SPL基因家族成员，系统发育树分析得到5个亚群。保守结构同源性分析发现，SPL基因家族都含有SBP-box的锌指结构和核定位信号。染色体定位发现除14号染色体没有SPL分布外，其他染色体均有不同数量的SPL基因分布。基因加倍、扩张分析表明，大豆SPL基因家族成员之间不存在串联重复，但是存在36对片段重复，表明部分大豆SPL基因可能是由基因重复产生；大豆与拟南芥SPL基因家族之间有29个基因之间存在共线性关系，表明大豆与拟南芥SPL基因家族之间具有较高同源性。本研究对SPL基因家族的进化分析，将有助于理解大豆SPL基因的结构、功能及进化关系，为深入研究大豆SPL基因的功能提供有利的理论依据。关键词大豆;SPL;基因家族;生物信息;转录因子BioinformaticsAnalysisofSoybeanSPLGeneFamilyWangWenli1,2DongYingshan2LiuXiaodong2WangYumin2ZhaoHongkun2YuanCuiping2QiGuangxun2WangYingnan2ZhengMeizhu1*LiYuqiu2*1CollegeofLifeSciences,ChangchunNormalUniversity,Changchun,130032;2SoybeanResearchInstitute,JilinAcademyofAgriculturalScience,Changchun,130033*Co-correspondingauthors,zhengmeizhu2008@126.com;lyqhb1@126.comDOI:10.13271/j.mpb.021.000717AbstractSQUAMOSApromoter-bindingprotein-like(SPL)transcriptionfactorswidelyexistinplants,mainlyinvolvedinplantgrowth,developmentandavarietyofphysiologicalandbiochemicalprocesses.Inordertoclarifythedistribution,conserveddomains,subfamilytypesandevolutionaryrelationshipsofsoybeanSPLgenefamilyonchromosomes,bioinformaticsmethodswereusedtoanalyzesoybeanSPLfamilygenes.Inthisstudy,43membersofSPLgenefamilywere...
