生物信息与数据处理生物信息与数据处理第八节原核生物的基因组第八节原核生物的基因组原核生物基因组的研究现状原核生物基因组的研究现状原核生物基因组的基本特征原核生物基因组的基本特征几种原核生物基因组的比较分析几种原核生物基因组的比较分析微生物基因组研究的应用微生物基因组研究的应用壹壹原核生物基因组的原核生物基因组的研究现状研究现状微生物基因组计划的发展史微生物基因组计划的发展史19861986年年::美国美国DOE(DepartmentofEnergy)DOE(DepartmentofEnergy)启动启动MGMGP(MicrobialGenomeProject)P(MicrobialGenomeProject)19941994年年::DOEDOE项目转向项目转向与环境或能源相关与环境或能源相关与系统发生学相关与系统发生学相关具有潜在商业应用价值的微生物基因具有潜在商业应用价值的微生物基因组计划组计划19951995年年::《《ScienceScience》》发表第一株细菌-流感嗜血杆菌发表第一株细菌-流感嗜血杆菌全基因组全基因组测序微生物测序微生物几乎所有类别的病毒几乎所有类别的病毒模式微生物模式微生物极端环境微生物极端环境微生物病原原核生物病原原核生物环境降解微生物环境降解微生物开发前景的微生物开发前景的微生物其他其他Viruses已完成测序的已完成测序的病原原核生物病原原核生物病原菌菌株数基因病原菌菌株数基因组大小组大小(Mb)(Mb)葡萄球菌(葡萄球菌(S.epidermidis;aureusS.epidermidis;aureus))62.50-2.62.50-2.8080肺炎链球菌(肺炎链球菌(S.pneumoniaeS.pneumoniae))32.1032.10化脓性链球菌(化脓性链球菌(S.pyogenesS.pyogenes))61.9061.90脑膜炎奈瑟菌(脑膜炎奈瑟菌(N.meningitidisN.meningitidis))22.2022.20致病性大肠杆菌(致病性大肠杆菌(EHEHEC;UPECEC;UPEC))55.2-5.5955.2-5.59志贺氏菌志贺氏菌((S.flexneri)S.flexneri)334.604.60沙门氏菌(沙门氏菌(S.typhietalS.typhietal))664.804.80霍乱弧菌(霍乱弧菌(V.choleraeV.cholerae))224.04.0创伤弧菌创伤弧菌((V.vulnificusV.vulnificus)2)25.215.21贰贰原核生物基因组原核生物基因组的的基本特征基本特征原核生物基因组的大小原核生物基因组的大小原核生物基因结构原核生物基因结构原核生物基因组的编码序列原核生物基因组的编码序列(CDS/ORF)(CDS/ORF)原核生物染色体结构原核生物染色体结构GCGC含量含量重复序列重复序列DNADNA链组成的非对称性链组...