第四节数据库与数据检索第四节数据库与数据检索一、重要生物信息中心简介一、重要生物信息中心简介11.分子生物信息数据库发展简史.分子生物信息数据库发展简史22.分子生物信息数据库分类.分子生物信息数据库分类33.核酸序列数据库.核酸序列数据库44.蛋白质序列数据库.蛋白质序列数据库55.疾病相关基因数据库.疾病相关基因数据库11.分子生物信息数据库发展简史.分子生物信息数据库发展简史6060年代初,年代初,Dr.MargaretOakleyDayhoff和她和她的同事们收集了所有当时已知的氨基酸序列,发表了《蛋白质序列及的同事们收集了所有当时已知的氨基酸序列,发表了《蛋白质序列及结构图谱》,建立了第一个生物信息数据库--这一蛋白质数据库后结构图谱》,建立了第一个生物信息数据库--这一蛋白质数据库后来成为蛋白质信息资源来成为蛋白质信息资源PIRPIR。。Dr.MargaretOakleyDayhoff(1925-1983)wasapioneerintheuseofcomputersinchemistryandbiology,beginningwithherPhDthesisprojectin1948.Herworkwasmulti-disciplinary,andusedherknowledgeofchemistry,mathematics,biologyandcomputersciencetodevelopanentirelynewfield.SheiscreditedtodayasafounderofthefieldofBioinformatics.Thisfieldisdefinedastheuseofcomputersinsolvinginformationproblemsinthelifesciences,mainlyinvolvingthecreationofextensiveelectronicdatabasesonproteinsequencesandgenomes.19821982年,第一个年,第一个DNADNA序列数据库在欧洲分子生物学实序列数据库在欧洲分子生物学实验室(验室(EMBLEMBL)诞生,随即就开始了一个数据库爆炸)诞生,随即就开始了一个数据库爆炸的时代。的时代。不久,美国洛斯阿拉莫斯(不久,美国洛斯阿拉莫斯(LosAlamosLosAlamos)国家实验)国家实验室建立了室建立了GenBankGenBank。。19881988年,美国组建了国家生物年,美国组建了国家生物技术信息中心(技术信息中心(NationalCenterforBiotechnologNationalCenterforBiotechnologyInformationyInformation,,NCBINCBI),并正式接管了),并正式接管了GenBankGenBank。。日本的日本的DNADNA数据库(数据库(DDBJDDBJ)于)于19841984年在三岛市建成。年在三岛市建成。GenBankGenBank、、EMBLEMBL和和DDBJDDBJ现在已组成国际核苷酸序列现在已组成国际核苷酸序列数据库合作体,每日进行数据交换。数据库合作体,每日进行数据交换。22.分子生物信息数据...