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基于线粒体控制区D-loop序列的洪泽湖翘嘴鲌遗传多样性分析.pdfVIP免费

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第46卷第2期2023年6月南京师大学报(自然科学版)JOURNALOFNANJINGNORMALUNIVERSITY(NaturalScienceEdition)Vol􀆰46No􀆰2Juneꎬ2023收稿日期:2022-10-16.基金项目:江苏省农业科技自主创新项目(CX(21)3003)、2021和2022年度省级单位项目(2021-SJ-110-03ꎻ2022-SJ-061-02).通讯作者:李大命ꎬ博士ꎬ研究员ꎬ研究方向:渔业种质资源监测和评估.E ̄mail:ldm8212@126.comdoi:10.3969/j.issn.1001-4616.2023.02.009基于线粒体控制区D ̄loop序列的洪泽湖翘嘴鲌遗传多样性分析杨子萍1ꎬ2ꎬ李大命1ꎬ刘燕山1ꎬ谷先坤1ꎬ杨家新2(1.南京师范大学海洋科学与工程学院ꎬ江苏南京210023)(2.江苏省淡水水产研究所ꎬ江苏省内陆水域渔业资源重点实验室ꎬ江苏南京210017)[摘要]为掌握洪泽湖翘嘴鲌(Culteralburnus)种质资源遗传多样性状况ꎬ采集洪泽湖6个群体共233尾翘嘴鲌ꎬ采用线粒体控制区D ̄loop全序列进行遗传多样性分析.结果显示ꎬ翘嘴鲌线粒体D ̄loop序列长度为934bp~936bpꎬ碱基(A+T)含量(66.0%)明显高于(G+C)含量(34.0%).243条D ̄loop序列检出23个变异位点ꎬ其中有9个单一信息位点ꎬ14个简约信息位点.6个群体发现22个单倍型ꎬ全部群体的单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为(0.794±0.019)和(0.00251±0.00014)ꎬ呈现出高Hd和低Pi的遗传多样性模式.6个群体中洪泽湖群体的遗传多样性最高(Hd:0.873±0.038ꎬPi:0.00295±0.00035)ꎬ顾勒河群体的遗传多样性最低(Hd:0.709±0.064ꎬPi:0.00203±0.00031).分子方差分析表明ꎬ群体间的分子变异占比0.43%ꎬ群体内的分子变异占比99.57%ꎬ分子变异主要发生在群体内.群体间遗传分化指数Fst为-0.01912~0.02801(P>0.05)ꎬ表明群体间没有出现遗传分化.单倍型系统进化树和单倍型网络结构图显示ꎬ群体间拥有多个共享单倍型ꎬ单倍型聚为一个进化分支ꎬ没有形成特定的地理遗传结构.中性检验结果表明洪泽湖翘嘴鲌群体没有经历显著种群扩张事件.研究结果表明ꎬ洪泽湖翘嘴鲌遗传多样性较低ꎬ6个群体间基因交流频繁ꎬ遗传...

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