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基于线粒体16S rRNA基因序列探讨中气门亚目的系统发育关系.pdfVIP免费

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∗doi:10.3969/j.issn.2095-1736.2023.04.048基于线粒体16SrRNA基因序列探讨中气门亚目的系统发育关系杨慧娟,陈婷,董文鸽(大理大学病原与媒介生物研究所云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室,大理671000)摘要为了解中气门亚目物种线粒体16SrRNA基因全序列信息及系统发育关系,采用PCR方法对粪堆寄螨(Parasitusfimetorum)的线粒体基因组进行测序,并结合NCBI数据库中中气门亚目多数类群的序列信息。利用生物信息学软件对中气门亚目物种的线粒体16SrRNA基因进行比较分析,进一步探讨中气门亚目物种间的系统发育及亲缘关系。结果表明:中气门亚目物种线粒体16SrRNA基因的AT含量远高于GC含量;遗传距离在0.111~0.359,平均遗传距离为0.291。碱基转换与颠换比值以及序列饱和性分析显示,中气门亚目物种线粒体16SrRNA基因具有较大的进化潜能,适合用于系统发育分析。使用ML法和BI法构建的系统发育树显示寄螨科与土革螨科形成姐妹分支,与传统分类结果存在差异;大部分同科的物种总是优先聚在一起,表明线粒体16SrRNA基因用于构建中气门亚目的系统发育关系具有稳定、可靠的特点。结果为后续研究中气门亚目物种的系统发育关系奠定基础。关键词中气门亚目;DNA条形码;线粒体基因组;16SrRNA;系统发育中图分类号Q969.91文献标识码A文章编号2095-1736(2023)04-0048-06PhylogeneticrelationshipofMesostigmatabasedonthemitochondrial16SrRNAgenesequenceYANGHuijuanCHENTingDONGWengeYunnanProvincialKeyLaboratoryforZoonosisControlInstituteofPathogensandVectorsDaliUniversityDali671000ChinaAbstractTounderstandthecompletesequenceinformationofmitochondrial16SrRNAgeneandthephylogeneticrelationshipsofMe-sostigmataspeciesthemitochondrialgenomeofParasitusfimetorumwassequencedbyPCRandcombinedwiththesequenceinforma-tionofmosttaxaofMesostigmataintheNCBIdatabase.Acomparativeanalysisofmitochondrial16SrRNAgenesofMesostigmataspe-cieswasperformedusingbioinformaticssoftwaretofurtherexplorethephylogenyandrelationamongMesostigmataspecies.TheresultsshowedthattheATcontentofthemitochondrial16SrRNAgenesofMesostigmataspecieswasmuchhigherthantheGCcontentthegeneticdistancerangedfrom0.111to0.359withanaveragegeneticdistanceof0.291.Thebaseconversiontoinversionratioandse-quencesaturationanalysisshowedthatthemitochondrial16...

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