解螺旋·陪伴医生科研成长www.helixlife.cn1lncRNA在肿瘤中的研究现状本综述由解螺旋学员阳负责修订(2018年10月)1.lncRNA概述长链非编码RNA(longnon-codingRNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200nt、不编码蛋白的RNA,这类RNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,2007年Hotair功能鉴定以来,lncRNA的功能渐渐明晰。据计算,约有93%的转录本为lncRNA,lncRNA通常位于细胞核和细胞质1。但是lncRNA的基因转录水平一般低于蛋白质编码基因,序列保守性差,承受的进化压力小,但启动子序列通常比较保守。lncRNA与小分子RNA相比,序列更长、空间结构也较为复杂,参与表达调控的机制更加多样和复杂。捕获测序技术(RNAcapturelongseq,CLS)能够以更高精度分析基因组,从而深入了解lncRNA2。【解螺旋www.helixlife.cn】根据lncRNA和编码基因的关系,LncRNA可分为(1)反义lncRNAs(antisenselncRNA):由蛋白编码基因的反向DNA序列转录产生;(2)正义lncRNAs(senselncRNA):转录自蛋白质编码基因,lncRNA与蛋白质编码基因共用一部分或全部DNA序列;(3)内含子(Intronic)lncRNA:来源于内含子序列;(4)基因间lncRNA(lincRNA),来源于两个基因之间的序列;(5)重叠转录的lncRNA(overlapping):编码序列是跨越内含子和外显子的lncRNA;(6)双向(Bidirectional)lncRNA:它的转录起始位点与相反链上编码蛋白质基因的转录起始位点非常接近(小于1000碱基),但转录方向相反;(7)其他:如eRNA、circRNA等。lncRNA作为人类基因组中重要调节因子,在表观遗传3、转录4及转录后5水平、翻译或翻译后水平6调控基因表达,参与发育、分化、代谢、X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活与抑制、核内运输等多种重要的调控过程,与人类疾病的发生、发展和防治都有着密切联系7。2.lncRNA与肿瘤研究表明,lncRNA的异常表达与肿瘤的发生、发展、复发、转移以及化疗耐药相关,可协助诊断、判断预后、提供治疗靶点8,9。(1)肿瘤的发生、发展:近年来研究发现lncRNA在肿瘤的发生与发展中,可以发挥介导作用。例如,癌基因RAS和MYC分别可以通过lncRNAOrilnc1和DANCR参与肿瘤的发生与发展10,11。在子宫内膜癌中,多种lncRNA(例如ASLNC04080、H19、OVAL、CASC2、MALAT1、HOTAIR、SRA、Linc-RoR等)都参与了疾病的发解螺旋·陪伴医生科研成长www.helixlife.cn2生发展。(2)肿瘤的侵袭、转移:多种lncRNA被证实可以调节肿瘤细胞的侵袭和转移。在胰腺癌中lncRNAHULC表达异常升高,其高表达...