分子机制研究套路（五）转录调控课题：转录因子A对B基因的转录调控1．概念介绍：转录水平的调控是真核生物基因表达调控中重要环节。真核细胞RNA聚合酶自身对启动子并无特殊亲和力，单独不能进行转录，也就是说基因是无活性的。因此，转录需要众多的转录因子和辅助转录因子形成复杂的转录装置。在基因转录起始阶段，通用转录因子协助RNA聚合酶与启动子结合，但其作用很弱，不能高效率地启动转录。只有在反式作用因子(基因特异性转录因子）的协助下，RNA聚合酶Ⅱ和TFⅡ才能有效地形成转录起始复合物。反式作用因子（transactingfactor）在转录调节中具有特殊的重要性。它是能直接或间接地识别或结合在顺式作用元件8～12bp核心序列上，参与调控靶基因转录效率的一组蛋白质。这类DNA结合蛋白有多种，能特异性识别这类蛋白的序列也有多种，正是不同的DNA结合蛋白与不同的识别序列之间的空间结构上的相互作用，以及蛋白质与蛋白质之间的相互作用构成了复杂的基因转录调控机制的基础。在真核生物中转录因子的调控是最重要，也是研究得最多的。蛋白质相互作用在转录因子活性的调控方面具有重要的意义。细胞内的反式作用因子都是处于有活性和无活性两种状态，这两种状态是可以转换的。反式作用因子处于无活性状态时，与之相应的基因就不能表达；反式作用因子处于有活性状态、并与相应的顺式作用元件结合时，就可以促进RNA聚合酶和通用转录因子与相应的启动子结合，形成转录起始复合物。所以，真核基因的表达调控主要是调节反式作用因子的活性，随后反式作用因子调控基因的转录起始。转录因子被激活后，即可识别并结合上游启动子元件和增强子，对基因转录发挥调控作用大部分转录因子在激活以后与顺式作用元件结合，但也可能有一些转录因子是先结合DNA，被激活后才发挥调节功能。增强子和上游启动子元件可以结合一些相同的蛋白质，在不同的基因中，存在着同样的顺式作用元件，这表明一些数量有限的基因调控蛋白控制着真核细胞的基因表达。每一种转录因子结合顺式作用元件后虽然可以发挥促进或抑制作用，但是转录因子对基因表达的调控不是由单一的因子完成的，而是几种因子组合，发挥特定的作用。通常是几种不同的转录因子控制一个基因的表达，一种转录因子也可以参与调控不同的基因表达调控转录因子的数量是有限的，转录因子的组合作用方式使有限的转录因子可以调控不同的基因表达。2．研究思路：2.1确定基因B启动子转录核心区域................................
