艺222AppliedPrevMed,Aug.2023,Vol.29No.4应用预防医学2023年8月第29卷第4期2018—2020年黔东南少数民族自治州肠道病毒A71型基因特征分析肖俊，单竹周，江忠晶，裴峰锋1，王宇²，唐小敏1.黔东南州疾病预防控制中心，贵州556000；2.贵阳市第一人民医院检验科；3.贵州省疾病预防控制中心摘要：目的对2018一2020年黔东南州手足口病（hand，footandmouthdisease，HFMD）进行鉴定分析，并对肠道病毒A组71型（enterovirusA71，EV-A71）VP1编码区进行基因特征分析。方法2018—2020年黔东南州共采集HFMD病例标本2789份，首先，采用荧光定量RT-PCR初筛肠道病毒核酸，阳性病例标本采用人类横纹肌肉瘤（humanrhabdomyosarcoma，RD）细胞进行病毒分离，对分离到的病毒株提取病毒核酸，经RT-PCR方法扩增VP1编码区核苷酸序列并进行序列测定。使用MEGA11.0软件构建遗传进化树进行基因特征分析。结果2789份HFMD标本中检出EV-A71核酸阳性标本为328份，阳性率为11.8%。从部分EV-71阳性患者的咽拭子及肛拭子中，分离培养获得7株病毒株，其中6株来自于轻症病例，另1株为重症病例，均属于EV-A71基因型C4a基因亚型，分成2个不同的簇。7株EV-A71VP1序列之间核苷酸和氨基酸同源性分别为89.8%~99.9%和98.0%～99.7%；与BrCr原型参考株间的核苷酸和氨基酸同源性分别为77.1%~78.8%和94.8%~96.6%；并在VP1有18处氨基酸位点发生变异。结论2018一2020年黔东南州EV-A71分离株属于C4a基因亚型，多处氨基酸位点存在变异，可导致多条传播链循环。关键词：肠道病毒；肠道病毒A组71型（EV-A71；基因型；手足口病（HFMD）中图分类号：R373.2*5文献标识码：A文章编号：1673-758X（2023)04-0222-06GeneticcharacteristicsofenterovirusA71inQiandongnanMiaoandDongAutonomousPrefecturefrom2018to2020XIAOJun*,SHANZhuzhou,JIANGZhongjing,PEIFengfeng,WANGYu,TANGXiaomin*QiandongnanCenterforDiseaseControlandPrevention,Qiandongnan,Guizhou556000,ChinaCorrespondingauthor:TANGXiaomin,E-mail:570819107@qq.comWANGYu,E-mail:wangzhongyuwy@163.comAbstract:ObjectiveToidentifyandanalyzethehand,foot,andmouthdisease(HFMD)inQiandongnanPrefecturefrom2018to2020,andanalyzethegeneticcharacteristicsofVP1codingregionofenterovirusA71(EV-A71).MethodsAtotalof2789HFMDcasespecimenswerecollectedinQiandongnanPrefecturefrom2018to2020.First,fluorescentquantitativeRT-PCRwas...
