麦类作物学报2023,43(9):1115-1124JournalofTriticeaeCropsdoi:10.7606/j.issn.1009-1041.2023.09.04网络出版时间:2023-07-07网络出版地址:https://kns.cnki.net/kcms2/detail/61.1359.S.20230707.0905.004.htmlInDel分子标记WC656的开发及其在鉴别小麦-簇毛麦5VS纯合易位中的应用收稿日期:2022-10-02修回日期:2022-11-25基金项目:江苏省农业科技自主创新资金项目[CX(19)1001];江苏省重点研发计划(现代农业)项目(BE2018350)第一作者E-mail:798326530@qq.com(郭江涛);Lyd0527@126.com(吕远大,与第一作者同等贡献)通讯作者:杨学明(E-mail:xmyang@jaas.ac.cn)郭江涛1,吕远大2,赵姝楠3,周淼平1,姚金保1,杨学明1(1.江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省农业生物学重点实验室,江苏南京210014;2.江苏省农业科学院卓越创新中心,江苏南京210014;3.南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京210095)摘要:簇毛麦是小麦品种改良重要的遗传资源,其5VS上含有硬度基因Dina/Dinb、抗白粉病基因Pm55和抗条锈病基因Yr5V,创制普通小麦-簇毛麦5VS易位系新种质,对于高效利用5VS上的有益基因进行小麦品种遗传改良具有重要意义。为了便于鉴别普通小麦-簇毛麦5VS纯合易位,本研究以mInDel软件分析普通小麦中国春基因组序列,开发了小麦第5同源群短臂的InDel特异分子标记WC656,对小麦品种以及普通小麦-簇毛麦5VS.5AL和5VS.5DL易位系及其衍生后代进行PCR扩增,根据扩增片段大小来区分5AS、5BS、5DS染色体臂以及5VS易位系。结果表明,在21个普通小麦品种、小麦-簇毛麦5VS回交F2代中杂合易位单株,均扩增出379bp(5AS)、471bp(5BS)、422bp(5DS)3条带。在T5VS.5AL高代品系、回交F2代中纯合易位单株扩增出471bp(5BS)、422bp(5DS)2条带,379bp(5AS)条带缺失。T5VS.5DL高代品系、回交F2代中纯合易位单株扩增出379bp(5AS)、471bp(5BS)2条带,422bp(5DS)条带缺失。WC656鉴别的5VS纯合易位结果与顺序FISH-GISH分析结果一致。T5VS.5AL、T5VS.5DL具有抗白粉病、籽粒硬度指数低等优良特性。因此,利用InDel分子标记WC656可以鉴别普通小麦-簇毛麦T5VS.5AL、T5VS.5DL衍生后代中的纯合易位,PCR扩增实验操作相对简便,可以为分子标记辅助选育携有5VS纯合易位的软质弱筋小麦提供帮助。关键词:小麦;簇毛麦;5VS纯合易位;InDel分子标记中图分类号:S512.1;S330文献标识码:A文章编号:1009-1041(2023)09-1115-10DevelopmentofInsertion-DeletionMolecularMarkerWC656andItsApplicationinIdentify...