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2016—2020年安徽省手足口病相关柯萨奇病毒A组16型分子分型研究.pdfVIP免费

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热带病与寄生虫学2023年8月第21卷第4期JTropDisParasitol,Aug.2023,Vol.21,No.4·手足口病防控专题·2016—2020年安徽省手足口病相关柯萨奇病毒A组16型分子分型研究冯明子1,傅荔艳1,葛盈露2,马婉婉2,王鹏2,孙永2,史永林1,21.安徽医科大学公共卫生学院,安徽合肥230032;2.安徽省疾病预防控制中心,安徽省公共卫生研究院,安徽省医疗卫生重点专科病原微生物分子生物学实验室摘要:目的了解安徽省手足口病(hand,footandmouthdisease,HFMD)相关柯萨奇病毒A组16型(coxsackievi-rusA16,CV-A16)基因型别分布情况。方法通过中国疾病预防控制信息系统传染病报告管理信息系统收集安徽省2016—2020年HFMD病例资料,并收集HFMD患儿咽拭子标本。对荧光定量PCR检出的CV-A16核酸阳性病例样本采用RT-PCR扩增VP1区基因片段并测序。运用肠道病毒在线分型工具确定基因型别,再利用MEGA6.0生物软件构建CV-A16VP1区基因进化树并分析VP1区氨基酸变异位点。结果2016—2020年安徽省累计报告HFMD实验室确诊病例16650例,其中CV-A16确诊病例3809例(占22.88%),各年中CV-A16确诊病例占比依次为20.72%(219/1057)、22.91%(677/2955)、23.89%(1004/4202)、42.58%(1687/3962)、4.96%(222/4474)。对获取的436份CV-A16阳性标本进行测序,获得290条VP1区基因序列,均属于B基因型,其中B1a基因亚型65条,B1b225条。290条VP1区基因序列核苷酸同源性为86.80%~100.00%,与CV-A16原型株G-10核苷酸同源性为74.10%~76.80%。65条B1a毒株VP1区基因序列与B1a参考株核苷酸同源性为93.00%~99.90%,225条B1b毒株VP1区基因序列与B1b参考株核苷酸同源性为88.40%~99.60%。B1a基因亚型流行株在遗传进化上分为4个分支簇,B1b基因亚型流行株在遗传进化上分为6个分支簇。与原型株G-10VP1区编码氨基酸位点变异分析显示,290条VP1区基因存在多个位点变异。结论2016—2020年安徽省HFMDCV-A16流行株B1a与B1b基因亚型二者共同流行,应持续关注安徽省肠道病毒病原监测与分子进化变异情况。关键词:手足口病;柯萨奇病毒A组16型;分子分型;安徽省中图分类号:R373.2文献标识码:A文章编号:1672-2302(2023)04-0199-05DOI:10.3969/j.issn.1672-2302.2023.04.005MoleculartypingofcoxsackievirusA16associatedhand,footandmouthdiseaseinAnhuiProvince,2016-2020FENGMingzi1,FULiyan1,GEYinglu2,MAWanwan2,WANGPeng2,SUNYong2,SHIYonglin1,21.SchoolofPublicHealth,AnhuiMedicalUniv...

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