安阳工学院学报JournalofAnyangInstituteofTechnologyVol.22No.2（Gen.No.122）Mar.,2023第22卷第2期（总第122期）2023年3月DOI:10.19329/j.cnki.1673-2928.2023.02.020乳腺癌标志物影响卵丘细胞基因表达的生物信息学分析桑茜1,白莹莹2,张圣杰2,张同浩2,穆志威2,谌馥佳2*（1安阳工学院，河南安阳455000；2黄淮学院，河南驻马店463000）摘要：为探讨乳腺癌患者大概率患有不孕症的情况，本研究应用生物信息学方法来研究乳腺癌标志物对卵丘细胞基因表达的影响。从NCBI的GEO数据库下载有关乳腺癌标志物的基因芯片数据库和卵丘细胞基因表达的基因芯片数据库。利用在线GEO2R筛选出2个数据库的差异基因，在EXCEL表格中进行筛选，对2个结果作韦恩图获得2个数据库差异基因的交集，利用DAVID6.8数据库对差异基因进行GO功能分析和KEGG通路分析，运用String-db数据库构建蛋白之间的相互作用图（PPI），导入Cytoscape3.6.1软件获取关键靶基因。本文通过生物信息学方法从不同角度揭示有关乳腺癌标志物对卵丘细胞差异基因表达的影响，为人类乳腺癌患者生育能力的提高带来新思路。关键词：生物信息学；乳腺癌标志物；卵丘细胞；差异表达蛋白；关键靶基因中图分类号：Q28文献标志码：A文章编号：1673-2928（2023）02-0103-08乳腺癌是全球发病率最高的女性恶性肿瘤。据调查全球乳腺癌患病人群约120万左右[1]，在我国每年约有30万人确诊乳腺癌[2]。随着现代医疗技术的不断进步，乳腺癌长期生存率逐步提高,越来越多的年轻患者对生育能力的需求日益明显[3]。现在，胚胎和卵母细胞冻存被认为是当今乳腺癌患者生殖力保护最成功的技术。microRNA是一种短的（长度在18到23nt之间）非编码RNA。几乎所有的生物学功能都可以通过miRNA转录后的基因沉默来调控，改变miRNA表达经常作为癌症开始和转移的标志[4]。microRNA-138作为三阴性乳腺癌（TNBC）的预后生物标记物，可抑制体内肿瘤的形成[5]。建立以microRNA-138为生物标志物的乳腺癌患者上调或下调基因，与卵丘细胞中差异基因表达的相互关系，筛选两者的交集即差异靶基因，对提高乳腺癌患者生育能力有重要的指导作用。新兴的生物信息学是研究生物信息的一门综合性学科[6-7]，利用基因芯片对数据进行综合数学统计分析，以计算机编程和生物学的各个工具为基础，同时结合统计分析方法、生物分子互联网络及各个通路分析、DNA序列比对、测序与拼接等途径对生物数据进行收集、存储、管理与提供。生物信息学的发展将对分子生物学、药...
