第39卷第2期2023年3月病毒学报CHINESEJOURNALOFVIROLOGYVol.39No.2March2023江西一例iVDPV病例Ⅲ型脊髓灰质炎病毒基因特征分析郭琴1，2，刘晓庆3，肖芳3，祝双利1，王东艳1，赵鹤鹤1，路环环1，肖金波1，杨倩1，李晓嫘1，朱晖1，冀天娇1，王雯慧4，何云4，孙强1，张勇1，5，许文波1，5，严冬梅1*（1.国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所，北京102206；2.达州中医药职业学院，达州635000；3.江西省疾病预防控制中心，南昌330029；4.山东第一医科大学，济南271016；5.中国科学院生物安全大科学研究中心，北京102206）摘要：分析江西一例免疫缺陷患者体内连续采集的15份粪便标本中分离到的III型脊髓灰质炎病毒的全长VP1区基因特征。将从15份标本中分离到的14株III型iVDPVs进行噬斑纯化，每个病毒随机挑取10个噬斑，接着进行逆转录‐聚合酶链反应扩增，测定获取到的154株iVDPVs全长VP1区序列。通过系统发育分析和BEAST程序探究iVDPV病毒的进化特征，估算其进化速率和口服脊灰减毒活疫苗（attenuatedoralpoliovaccine，OPV）初始感染时间。14株iVDPVs与III型脊髓灰质炎减毒疫苗株（SabinIII）核苷酸和氨基酸同源性分别为97.8%~98.7%和97.6%~98.3%。相较于SabinIII，14株iVDPVsVP1区第54位氨基酸发生了A→V的突变，这可能导致温度敏感表型和衰减表型的改变。根据拓扑结构系统发育树被划分为3个Lineages，其中17049‐1‐8，17049‐2‐2和17049‐2‐9分别属于Lineage1和Lineage2，其余属于Lineage3。具有Lineage3序列特征的克隆是优势克隆，呈现出随时间持续分化的特征。BEAST程序估算的14株iVDPVs全长VP1区核苷酸平均进化速率为9.29×10‐3/位点/年（95%置信区间：2.81×10‐3‐1.59×10‐2），OPV初始感染时间为2012年11月18日。MCC树（maximumcladecredibilitytree）显示前4个遗传分支的分化仅用了40d。14株III型iVDPVs具有高度相关性，它们感染患儿后进化非常迅速，在慢性感染的早期便开始了谱系的分化。突变的不断积累和关键位点的改变可以引起iVDPVs神经毒力的变化，导致患儿出现AFP症状。iVDPV病例持续的排毒给脊灰根除目标的实现带来了巨大挑战，在脊髓灰质炎消灭的最后阶段及时调整免疫策略，继续维持较高的免疫覆盖率，保持iVDPV监测的灵敏性显得十分重要。关键词：脊髓灰质炎病毒；免疫缺陷...
