ICS11.020C51DB45广西壮族自治区地方标准DB45/T2138—2020水体中诺如病毒的核酸检测方法实时荧光RT-PCR法Detectionofnorovirusnucleotideacidinwater—Real-timeRT-PCR2020-07-24发布2020-08-20实施广西壮族自治区市场监督管理局发布DB45/T2138—2020Ⅰ前言本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。本标准由广西壮族自治区卫生健康委员会提出并宣贯。本标准由广西壮族自治区卫生技术标准委员会归口。本标准起草单位:广西壮族自治区疾病预防控制中心。本标准主要起草人:刘巍、邓丽丽、谭冬梅、马宇燕、钟革、李秀桂。1水体中诺如病毒的核酸检测方法实时荧光RT-PCR法1范围本标准规定了水体中诺如病毒的实时荧光RT-PCR检测方法。本标准适用于广西区域内地表水、地下水、集中式供水、娱乐用水、污水等水体中基因Ⅰ组和基因Ⅱ组诺如病毒的检测。2术语和定义下列术语和定义适用于本文件。2.1诺如病毒Norovirus世界范围内引起急性胃肠炎暴发和散发的重要病原体。大多数诺如病毒引起的水源性暴发疫情是由于饮用水或生活用水被污染所致。诺如病毒属于人类杯状病毒科的诺如病毒属,是一组形态相似、抗原性略有不同的病毒颗粒。诺如病毒直径26nm~35nm,无包膜,表面粗糙,球形,呈二十面体对称。诺如病毒基因组是单股正链RNA,全长7.5kb~7.7kb,根据基因特征,诺如病毒被分为6个基因组(genogroup,GⅠ~GⅣ),GⅠ和GⅡ是引起人类急性胃肠炎的两个主要基因组,GⅣ也可感染人,但很少被检出。2.2实时荧光逆转录-聚合酶链式反应Real-timeRT-PCR在RT-PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程,最后通过Ct值对模板进行定性。2.3Ct值Cyclethresholdvalue每个PCR反应管内荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数。各模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,Ct值越小。反之亦然。3原理水样在通过带负离子混合纤维素膜时,带正离子的病毒被吸附到膜上,然后再洗脱病毒,并用聚乙二醇沉淀病毒达到富集浓缩的效果。应用实时荧光RT-PCR技术,针对诺如病毒衣壳蛋白区N/S区设计特异性引物和探针,荧光探针的5’端标记报告荧光基团,3’端标记淬灭荧光基团,当探针完整时,报告荧光基团的发射波长被淬灭荧光基团的激发波长吸收;当PCR扩增时,Taq酶的5’→3’端外切酶活性将探针酶切水解,报告荧光不再受淬灭荧光的影响,使荧光监测系统收集到报告基团的荧光信号,即每扩增一条DNA链,可产生一个报告基团的荧...