ｄｏｉ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００６⁃５７０９．２０２３．０６．００３基金项目：国家自然科学基金（８１８７３８６７）第一作者简介：田琳琳，在读硕士，研究方向：肿瘤学。Ｅ⁃ｍａｉｌ：ｌｙｉｕｎｅ＠ｆｏｘｍａｉｌ．ｃｏｍ通讯作者：殷旭东，主任医师，研究方向：肿瘤疾病。Ｅ⁃ｍａｉｌ：ｘｄｙｉｎ＠ｙｚｕ．ｅｄｕ．ｃｎ基于ＴＣＧＡ和ＧＥＯ数据库结肠癌表观遗传预后模型构建与验证田琳琳１，葛建顺２，贾筱琴２，路国涛２，殷旭东２，３１．大连医科大学，辽宁大连１１６０００；２．扬州大学消化病研究所；３．扬州大学附属医院肿瘤科【摘要】目的使用ＴＣＧＡ和ＧＥＯ数据库构建结肠癌（ｃｏｌｏｒｅｃｔａｌｃａｎｃｅｒ，ＣＲＣ）表观遗传的预后模型并验证。方法首先，公共数据库下载试验组数据（ＴＣＧＡ⁃ＣＯＡＤ，ｎ＝４４６）、验证组数据（ＧＳＥ３９５８２，ｎ＝５６１）及表观遗传基因（ＥｐｉＦａｃｔｏｒｓ，ｎ＝７２０）；其次，单因素Ｃｏｘ回归筛选ＴＣＧＡ、ＧＥＯ预后相关的基因，与ＥｐｉＦａｃｔｏｒｓ数据库交集得到表观遗传相关影响预后的基因（ｅｐｉｇｅｎｅｔｉｃ⁃ｒｅｌａｔｅｄｇｅｎｅｓ，ＥＲＧｓ）并对其进行富集分析；随后，多因素Ｃｏｘ回归构建预后模型，绘制列线图并验证。结果本研究共筛选得到６个ＥＲＧｓ，并构建预后模型，预测模型ＲＯＣ的ＡＵＣ为０．７２２，１年、３年和５年的校准曲线与实际结果相吻合，提示预测能力良好。结论本研究通过公共数据库筛选出６个ＥＲＧｓ（ＬＢＲ、ＳＭＡＲＣＤ３、ＺＮＦ５３２、ＭＡＰＫＡＰＫ３、ＳＦＰＱ、ＳＩＮ３Ｂ）与结肠癌预后密切相关。【关键词】结肠癌；表观遗传；预后模型；列线图中图分类号：Ｒ７３５．３文献标识码：Ａ文章编号：１００６－５７０９（２０２３）０６－０６１３－０６收稿日期：２０２２⁃０６⁃１４ＣｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎａｎｄｖａｌｉｄａｔｉｏｎｏｆａｎｅｐｉｇｅｎｅｔｉｃｐｒｏｇｎｏｓｔｉｃｓｉｇｎａｔｕｒｅｏｆｃｏｌｏｒｅｃｔａｌｃａｎｃｅｒｂａｓｅｄｏｎＴＣＧＡａｎｄＧＥＯｄａｔａｂａｓｅｓＴＩＡＮＬｉｎｌｉｎ１，ＧＥＪｉａｎｓｈｕｎ２，ＪＩＡＸｉａｏｑｉｎ２，ＬＵＧｕｏｔａｏ２，ＹＩＮＸｕｄｏｎｇ２，３１．ＤａｌｉａｎＭｅｄｉｃａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｄａｌｉａｎ１１６０００；２．ＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＤｉｇｅｓｔｉｖｅＤｉｓｅａｓｅｓ，Ｙａｎｇｚｈｏ...
