第41卷第2期2023年4月四川农业大学学报JournalofSichuanAgriculturalUniversityVol.41No.2Apr.2023芥菜全基因组中Hsf基因家族鉴定与分析杨巍1,2,唐兵1,2,谭国飞1,2,付文苑1,2,王青青1,2,曾庆鸿3,王洪亮3,马建云4,张睿4,施绍斌5,邓英1,2*(1.贵州省农业科学院园艺研究所,贵阳550006;2.贵州省园艺工程技术研究中心,贵阳550006;3.贵州省农业科技发展中心,贵阳550006;4.威宁县农业农村局,贵州威宁553100;5.威宁县大西北种养殖专业合作社,贵州威宁553100)摘要:【目的】通过鉴定与分析芥菜基因组中Hsf转录因子家族成员,为芥菜Hsf基因功能研究与遗传改良提高抗逆性提供理论依据。【方法】利用生物信息学方法分析芥菜Hsf热激转录因子家族成员的功能结构、保守基序、启动子顺式作用元件、系统进化、共线性及采用RNA-seq验证Hsf低温胁迫的基因表达。【结果】芥菜基因组中鉴定出71个Hsf基因家族成员,分布于18条染色体上,归类为3个亚家族,蛋白均含有DBD和HR-A/B结构域。BjuHsf启动子区域包含与逆境胁迫、激素、生长发育等相关顺式作用元件。系统进化与共线性分析表明,芥菜Hsf家族成员与大白菜Hsf家族成员具有更近的亲缘关系。在低温胁迫下,BjuHsf基因表达分析表明8个BjuHsf基因显著上调表达。【结论】这些显著差异表达BjuHsf基因与芥菜抗寒性极其相关,可作为芥菜耐寒性遗传改良的候选基因。关键词:芥菜;热激转录因子;生物信息学;表达分析中图分类号:S637文献标志码:A文章编号:1000-2650(2023)02-0295-12Genome-WideIdentificationandAnalysisoftheHeatShockTranscriptionFactorFamilyinBrassicajunceaL.YANGWei1,2,TANGBing1,2,TANGuofei1,2,FUWenyuan1,2,WANGQingqing1,2,ZENGQinghong3,WANGHongliang3,MAJianyun4,ZHANGRui4,SHIShaobin5,DENGYing1,2*(1.InstituteofHorticulture,GuizhouAcademyofAgriculturalSciences,Guiyang550006,China;2.GuizhouHorticulturalEngineeringTechnologyResearchCenter,Guiyang5500006,China;3.GuizhouAgriculturalScienceandTechnologyDevelopmentCenter,Guiyang550006,China;4.AgriculturalandRuralBureauofWeiningCounty,Weining553100,Guizhou,China;5.WeiningCountyNorthwestBreedingProfessionalCooperative,Weining553100,Guizhou,China)Abstract:【Objective】ThispaperaimstoidentifyandanalyzethemembersofHsftranscriptionfactorf...