*食源性疾病监测*福建省福州市食源性疾病暴发事件副溶血弧菌基因组遗传特征分析李钰娴1,2,3，刘秀峰2,3，陈凡冰2,3，陈智伟2,3，叶海梅2,3，潘洁茹2,3，刘杰2,3摘要：目的获得福建省福州市四起暴发事件分离的副溶血弧菌序列分布特点，并分析不同菌株间遗传关系。方法对19株副溶血弧菌进行全基因组序列测定，使用相应的生物信息学软件对测序数据进行基因组装和基因预测，借助相关数据库获得不同菌株的多位点序列分型、耐药基因和毒力基因情况，采取最大似然法构建系统发育树。结果19株副溶血弧菌依据7个管家基因分型，得到4种序列型（ST），其中ST3为优势型，1株菌暂定为未知型。全部菌株均携带β-内酰胺类和四环素类抗生素耐药基因，同时携带影响宿主细胞致病力的重要毒力基因。2种喹诺酮类耐药基因和trh毒力基因仅在F265菌株中检出。全基因组系统发育树进化分析结果显示，暴发菌株被分成3个进化分支，E2019、E2020-1和E2020-2的菌株主要集中在lineageB进化分支，E2018的菌株均在lineageC进化分支。结论四起暴发事件由ST3克隆复合体主导，并伴随其他ST型别菌株的影响。同起暴发事件分离菌株具有遗传多样性，菌株测序数据为暴发事件溯源提供技术支持。关键词：副溶血弧菌；暴发；全基因组测序；多位点序列分型；系统发育树中图分类号:R211;R378.3文献标志码:A文章编号:1003−9961（2023）05−0548−06GenomiccharacteristicsanalysisonVibrioparahaemolyticusisolatedfromfood-bornediseasesoutbreaksinFuzhou,FujianprovinceLiYuxian1,2,3,LiuXiufeng2,3,ChenFanbing2,3,ChenZhiwei2,3,YeHaimei2,3,PanJieru2,3,LiuJie2,3.1.SchoolofPublicHealth,FujianMedicalUniversity,Fuzhou350122,Fujian,China;2.FuzhouMunicipalCenterforDiseaseControlandPrevention,Fuzhou350004,Fujian,China;3.FuzhouMunicipalCenterforDiseaseControlandPrevention,FujianMedicalUniversity,Fuzhou350004,Fujian,ChinaCorrespondingauthor:LiuXiufeng,Email:liuxiufengaa@163.comAbstract:ObjectiveToobtainthesequencedistributioncharacteristicsofVibrioparahaemolyticusstrainsisolatedfromfouroutbreaksinFuzhou,Fujianprovince,andanalyzegeneticcorrelationsamongdifferentstrains.MethodsThe19strainsofV.parahaemolyticusweresequencedwithwholegenomesequencing(WGS).Genomeassemblyandgenepredictionforsequencedstrainswereperformedusingcorrespondingbio...
