第43卷第3期2023年03月Vol.43NO.3MAR.2023赣南医学院学报JOURNALOFGANNANMEDICALUNIVERSITY投稿网址：http：//gnyxyxb.gmu.cn基于高通量测序技术研究原发性胃癌患者胃肠道菌群特征凌宝殿1，谢志军2，张文娟1，王晓玲1，王芳胜1，胡晓梅1，赖姨梅3，吴何莉2，胡龙华4（1.赣南医学院第一附属医院检验科；2.赣南医学院第一附属医院消化内科；3.赣南医学院第一附属医院病理科，江西赣州341000；4.南昌大学医学院第二附属医院检验科，江西南昌330000）摘要：目的：探讨原发性胃癌患者胃肠道菌群种类和分布构成，探究原发性胃癌患者的微生态与癌变发生相关性，并寻找可能存在的菌群生物标志物。方法：根据纳入排除标准，分别收集未经治疗的5例初诊胃癌患者（胃癌组）和5例健康对照人群（对照组）胃黏膜和粪便样本，共20个样本，采用16SrDNA基因高通量测序技术检测胃癌组和对照组胃肠道菌群，通过PICRUSt2预测菌群功能差异。结果：操作分类单元（OperationaltaxonomicunitsOTU）物种多样性分析显示，胃癌组和对照组胃黏膜样本优化序列数量差异无统计学意义，但胃癌组粪便（WAFB）OTU数明显高于对照组。两组间ɑ多样性指数Dominance、Shannon、Chao1、Simpson、Pielou_e及Observed_otus比较差异均无统计学意义，但距离矩阵与（主坐标分析）PCoA分析显示两组菌群结构存在显著差异。线性判别效应分析（LefSe）结果显示，在细菌分类的门水平上，与对照组相比，胃癌组黏膜（WANM）古细菌和拟杆菌门丰度降低，而厚壁菌门和弯曲杆菌门丰度增加，胃癌组粪便（WAFB）的厚壁菌门和放线菌门丰度降低，而变形杆菌门、拟杆菌门和弯曲杆菌门丰度增加。在属水平上，胃癌组大肠埃希菌－志贺菌属（Escherichia-Shigella）丰度高于对照组，而拟杆菌属（Bacteroides）等益生菌则低于对照组。功能基因预测结果显示，胃癌组与对照组菌群代谢通路存在差异。结论：胃癌患者胃肠道菌群多样性和结构发生了特征性改变，其中在门水平上，无论是胃黏膜菌群，还是肠道菌群，其拟杆菌门和变形杆菌门为具有显著差异的标志性菌群，在属水平上，胃癌患者大肠埃希菌－志贺菌属（Escherichia-Shigella）丰度显著增高，而拟杆菌属（Bacteroides）等益生菌则显著降低。大肠埃希菌－志贺菌属（Escherichia-Shigella）可能作为本地区胃癌患者潜在的生物标志物。关键词：胃黏膜菌群；肠道菌群；胃癌；16SrDNA中图分类号：R735.2文献标志码：A文章编号：1001-5779（2023）03-0228-07DOI:10.3969/j.is...
