2023,31(4):22391,pages1–10doi:10.17520/biods.2022391——————————————————收稿日期:2022-07-09;接受日期:2022-11-14基金项目:国家自然科学基金(51979123)、湖北省高等学校优秀中青年科技创新团队计划项目(T2020034)和江汉大学科技创新专项项目(2021kjzx006)*共同通讯作者Co-authorsforcorrespondence.E-mail:lhy9603@126.com;duan@yfi.ac.cnhttps://www.biodiversity-science.net基于基因组重测序的长江上游瓦氏黄颡鱼群体遗传结构熊飞1,2,刘红艳1,2*,翟东东1,2,段辛斌3*,田辉伍3,陈大庆31.江汉大学生命科学学院,湖北省汉江流域特色生物资源保护开发与利用工程技术研究中心,武汉430056;2.江汉大学持久性有毒污染物环境与健康危害湖北省重点实验室,武汉430056;3.中国水产科学研究院长江水产研究所,武汉430223摘要:利用基因组重测序的方法获取高通量SNP标记,分析了长江上游三峡大坝-白鹤滩大坝之间8个不同江段(太平溪、巴南、合川、岷江口、宜宾、邵女坪、桧溪、冯家坪)共136尾瓦氏黄颡鱼(Pelteobagrusvachelli)的遗传多样性和遗传分化水平,阐明了长江上游瓦氏黄颡鱼群体遗传结构。结果显示:(1)三峡库区太平溪群体和巴南群体具有较高的SNP(singlenucleotidepolymorphism)数量和核苷酸多样性指数,遗传来源丰富,其遗传多样性高于其他群体;上游的岷江口、宜宾、邵女坪和冯家坪群体遗传来源单一。(2)瓦氏黄颡鱼存在3个不同的遗传分支,且不同遗传分支之间存在较大的遗传分化。(3)群体SNP数量和核苷酸多样性指数与河流坡降呈显著负相关,群体遗传分化指数与地理距离和隔离时间无显著相关性。研究结果表明,在三峡大坝-白鹤滩大坝江段,瓦氏黄颡鱼上游群体具有更低的遗传多样性,更易发生遗传漂变作用,在鱼类遗传多样性保护中需要特别关注;瓦氏黄颡鱼存在3种显著的遗传结构,应视为3个不同遗传单元进行种质资源管理。关键词:瓦氏黄颡鱼;长江上游;遗传分化;遗传多样性;基因组重测序熊飞,刘红艳,翟东东,段辛斌,田辉伍,陈大庆(2023)基于基因组重测序的长江上游瓦氏黄颡鱼群体遗传结构.生物多样性,31,22391.doi:10.17520/biods.2022391.XiongF,LiuHY,ZhaiDD,DuanXB,TianHW,ChenDQ(2023)PopulationgeneticstructureofPelteobagrusvachelliintheupperYangtzeRiverbasedongenomere-sequencing.BiodiversityScience,31,22391.doi:10.17520/biods.2022391.PopulationgeneticstructureofPelteobagrusvachelliintheupperYangtzeRiverbasedongenomere-seq...
