宁夏医科大学学报45卷胰腺导管腺癌（pancreaticductaladenocarci－noma，PDAC）是一种恶性程度极高并具有高度侵袭性的消化道恶性肿瘤。因其5年生存率不足7%，是恶性肿瘤中预后最差的[1-2]。PDAC早期的症状隐匿、不典型[3]，约80%的患者被确诊时为中晚期或出现转移，已错失最佳手术根治的窗口和机会。即使成功实施手术干预，术后12个月内的复发率和转移率仍高达60%[4]。因此，准确有效的生物标记物筛选及其分子机制研究对于PDAC的诊断、治疗和不良预后改善具有十分重要的临床意义和研究价值。加权基因共表达网络（weightedgeneco-ex－pressionnetworkanalysis，WGCNA）已被广泛用于寻找各种癌症中的枢纽基因。癌症基因组图谱（thecancergenomeatlas，TCGA）数据库中缺乏正常组织的PDAC样本，差异表达数据不完整。因此，本研究整合基因型-组织表达数据库（genotype-tissueexpression，GTEx）数据库中正常对照组织的表达数据，有效地克服TCGA数据库对照样本不足的问题。通过差异表达分析，获得PDAC原发癌全面的转录组表达谱，并使用WGCNA、蛋白质相互作用网络（protein-proteininteraction，PPI）网络分析结合表达生存分析，获得核心风险基因，以识别潜在准确的PDAC生物标记物。1材料与方法1.1数据获取与处理PDAC组织的RNA-seq数据来自TCGA，匹配的正常组织表达数据来自GTEx[5]。过滤去除基因表达值低于lcpm剪切阈值80%以上的样本，通过filterByExpr函数去除表达矩阵中不表达或低表达的基因。最后纳入共312个样本，包含147例原发肿瘤组织，165例正常组织（图1）。1.2差异表达分析使用edgeR包筛选差异表达基因（differentialexpressiongenes，DEGs），以log2（FoldChange）>1且调整P<0.05为标准，筛选DEGs并绘制热图和火山图。1.3GO和KEGG富集分析基因本体（geneontology，GO）包含生物过程收稿日期：2022-11-15基金项目：宁夏医科大学校级特殊人才启动项目（XT2018018）作者简介：景晓莹（1996—），女，在读硕士研究生，研究方向：肿瘤遗传。通信作者：马占兵（1986—），男，副教授，硕士研究生导师，主要从事复杂疾病相关生物信息学研究。E-mail：20130108@nxmu.edu.cn基于生物信息学的胰腺导管腺癌核心风险基因筛选和分析景晓莹1，彭亮1，谢娜娜1，吕环环1，党洁1，2，马占兵1，2（1.宁夏医科大学基础医学院，银川750004；2.宁夏医科大学生育力保持教育部重点实验室，银川750004）摘要：目的基于癌症基因组图谱（thecancergenomeatlas，TCGA）和基...
