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宏基因组二代测序技术检测脓毒症患者感染性病原体的研究_乔薇.pdfVIP免费

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甘肃医药2023年42卷第4期GansuMedicalJournal,2023,Vol.42,No.4脓毒症是ICU常见的急危重症,具有起病急、进展快、死亡率高等特点,初始经验性抗感染策略是否有效直接影响脓毒症患者的预后[1]。早期抗感染策略的制定应覆盖可能的致病菌,临床医生一般根据患者的病史、症状体征、临床特点、化验检查及辅助检查结果来确定疑似感染部位,初步判定可能感染的微生物及选择抗感染药物,并根据治疗过程中临床症状、炎性变量、病原学结果等调整抗感染的处方,在不断的诊断-治疗-评估-调整中以期达到抗感染的精准化,提高治愈率,降低死亡率,减少耐药的发生。而这种“部位向导的重症感染治疗策略”根本上仍是以不同感染部位主要致病微生物谱系为依据的,因此,了解脓毒症患者病原谱对于临床医生制定早期的抗感染策略至关重要。2014年,Wilson教授团队应用二代测序技术(NGS)发现了脑脊液中钩端螺旋体感染[2],从此二代测序被引入重症疾病病原学领域[3,4],这些报道显示出NGS技术在病原学检测的全面性、敏感性、准确性、时效性方面的巨大优势[3-5],但可惜的是,国内尚无基于宏基因二代测序技术(mNGS)检测结果分析整理脓毒症患者病原体谱系的相关研究,本研究则利用该技术构建脓毒症患者感染病原体谱系并分析其特征,为脓毒症患者初始经验性抗微生物策略的制定提供依据。1资料和方法1.1研究对象选取2020年7月至2021年7月我院ICU收治的脓毒症患者60例。其中男性38例,年龄(63.33±16.28)岁;女性22例,年龄(63.50±15.82)岁。诊断及治疗原则均符合2016年国际脓毒症诊治指南[6]。纳入标准:①符合脓毒症诊断标准[6];②临床资料完善;③知情同意,并进行了mNGS测序。排除标准:①年龄小于18岁;②肿瘤患者;3①长期服用激素及免疫抑制剂患者;4①血液系统相关疾病患者;5①中途放弃或转诊治疗患者。本研究经首都医科大学大兴医院伦理委员会审核批准(No.LLKYLX-1-202),所有患者均知情并签署知情同意书。1.2常规微生物学培养取符合纳入标准的患者疑似感染灶分泌物、组织液、体液为送检样本,如感染灶不明确则取外周血样本(10mL)进行培养,如结果阳性进行细菌、真菌分株并行药敏试验。1.3mNGS检测及数据分析取患者疑似感染灶分泌物、组织液、体液(肺泡灌洗液≥5mL,脑脊液≥1mL,痰液≥1mL,胸水≥5mL,腹水≥5mL)为送检样本,如感染灶不明确则取外周血样本(5mL)替代,置于cfDNA试管(cell-freeDNAtube)中,并将采集好的样本置于...

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