安徽农学通报2023年03期基因分子·生理生化·遗传育种·组织培养猴樟CbMYB308转录因子基因克隆及生物信息学分析胡甜叶苏梅郝瑷滢王艺润韩浩章*张颖王晓李张丽华（宿迁学院，江苏宿迁223800）摘要为研究猴樟CbMYB308蛋白的序列结构和功能，该文克隆猴樟CbMYB308基因CDS序列，进行生物信息学分析。结果表明，克隆得到的序列具有1个942bp完整的ORF框，编码313个氨基酸，与沉水樟中收录的RWR91885.1基因序列一致性达97.29%，系统进化树的结果表明，猴樟CbMYB308蛋白具有较高的保守性；猴樟CbMYB308蛋白生物信息学分析结果表明，CbMYB308蛋白具有PLN03091家族结构域，为R2R3-MYB型转录因子，CbMYB308蛋白化学分子式为C1496H2356N432O489S11，相对分子量34.57kDa，理论等电点6.12，结构不稳定，无序化特征明显，为脂溶性和亲水性蛋白，磷酸化氨基酸位点有53个，亚细胞定位预测为细胞核。关键词猴樟；转录因子；基因克隆；生物信息学分析中图分类号S792.23文献标识码A文章编号1007-7731（2023）03-0014-04猴樟（CinnamomunbodinieriLevl.）为樟科樟属常绿乔木，主要分布于我国南方地区，是我国重要的精油加工树种、绿化树种和林用树种。我国关于猴樟的研究主要集中于精油资源、林用特性、组培技术和引种栽培等方面，近年来的研究表明，猴樟的生长速度和抗寒性优于香樟[1]，可以替代香樟在我国北方地区推广应用。很早就进行了香樟新品种选育工作，相继选育出涌金、霞光、御黄等彩叶品种[2-4]，然而，关于猴樟彩叶新品种选育较少。研究表明，花青素种类、组成及其代谢调控是植物叶片呈色的关键因素，而花青素代谢主要受转录因子MYB、bHLH、WD40及其复合物的调控[5]，其中MYB类转录因子调控功能研究最受关注，本研究基于转录组数据筛选出调控植物花青素合成的转录因子，并分析其特性，以期为猴樟新品种选育提供基因资源。1材料与方法1.1试验材料试验材料为猴樟变种（春季叶色为红色）2年生种苗，于2019年3月上旬播种，2021年3月上旬进行移栽。于2021年8月20日，取猴樟枝条顶部幼嫩叶片进行液氮速冻后，用RNAperpPurePlantKit（天根，北京）试剂盒提取材料的总RNA，按照PrimeScriptTMRTre⁃agentKitwithgDNAEraser（TaKaRa，大连）方法去除基因组DNA后，用TRPrimeMix（randomprimer）进行反转录反应，获得的cDNA产物作为模板。1.2基因克隆根据猴樟转录组数据，获得在红叶猴樟变种叶片中上调表达的MYB转录因子基因序列，使用PrimerPremier5.0软件设计CDS扩增引...
