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ACCN3和PXDNL对乳...、迁移和患者生存预后的影响_匡思杰.pdfVIP免费

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·生物信息学·doi:10.3969/j.issn.1671-8348.2023.09.023网络首发https://kns.cnki.net/kcms/detail/50.1097.R.20230414.2004.007.html(2023-04-17)ACCN3和PXDNL对乳腺癌细胞增殖、侵袭、迁移和患者生存预后的影响*匡思杰1,成宏1,孙敬杰2△(1.恩施土家族苗族自治州中心医院乳腺外科,湖北恩施445000;2.解放军总医院海南医院肿瘤内科,海南三亚572013)[摘要]目的鉴定影响乳腺癌患者生存预后的肿瘤特征,探究酸敏感离子通道3(ACCN3)和过氧化物酶样蛋白(PXDNL)对乳腺癌细胞增殖、侵袭、迁移和患者生存预后的影响。方法利用单样本基因富集分析(ssGSEA)和Cox回归分析评估不同肿瘤特征与乳腺癌预后的相关性,加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定与肿瘤特征相关性最高的基因模块,寻找与缺氧有关的关键基因(Hub基因),利用细胞功能实验对所得到的基因进行验证。结果14种肿瘤特征中,缺氧(P=0.002,coef=25.31)、血管生成(P<0.001,coef=19.71)、肿瘤干性(P=0.039,coef=11.78)、细胞周期(P=0.027,coef=0.43)、DNA损伤(P=0.014,coef=0.02)、DNA修复(P=0.016,coef=0.044)与乳腺癌患者生存明显相关。其中缺氧通路评分对乳腺癌患者生存有明显影响。针对缺氧有关的Hub基因进行分析,共得到4个Hub基因:酪氨酸酶相关蛋白1(TYRP1)、蛋白酪氨酸磷酸酶H型受体(PTPRH)、ACCN3、PXDNL,其中ACCN3表达与乳腺癌患者生存明显相关(P=0.005),低表达患者生存预后较差;PXDNL表达与乳腺癌患者生存明显相关(P<0.001),高表达患者生存预后较差。细胞功能实验结果显示,当乳腺癌细胞PXDNL表达下调,乳腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力均被抑制;而ACCN3则呈现相反的效应。结论ACCN3和PXDNL对乳腺癌增殖、侵袭和转移有明显影响,与患者生存预后相关,参与乳腺癌的进展。[关键词]乳腺癌;加权基因共表达网络分析;单样本基因富集分析;酸敏感离子通道;过氧化物酶样蛋白[中图法分类号]R737.9[文献标识码]A[文章编号]1671-8348(...

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