植物遗传资源学报2023,24(3):661-670DOI:10.13430/j.cnki.jpgr.20221031002JournalofPlantGeneticResources基于SNP标记揭示广西糯玉米地方品种的遗传多样性与群体遗传结构范競升1,谢和霞2,谢小东2,周海宇2,程伟东2,覃兰秋2,江禹奉2(1广西壮族自治区亚热带作物研究所,南宁530001;2广西壮族自治区农业科学院玉米研究所/国家玉米改良中心广西分中心,南宁530007)摘要:为了挖掘优异糯玉米种质资源,提高糯玉米育种效率,本研究利用10K玉米基因芯片对207个广西糯玉米地方品种和6份参考自交系进行全基因组扫描,解析广西糯玉米地方品种之间的遗传多样性与群体遗传结构。结果表明,广西糯玉米种群总体的遗传多样性较高,平均期望杂合度(He)为0.31,平均观察杂合度(Ho)为0.23,多态信息含量(PIC)平均值为0.25,最小等位基因频率(MAF)平均值为0.23。种群水平上,桂中区域的遗传多样性水平最高(He=0.32,Ho=0.24,MAF=0.24,PIC=0.26)。群体遗传结构分析将地方品种划分为4大类群,种群间遗传关系和类群归属与地理位置不完全相关,品种间总体遗传相似系数偏低,遗传多样性丰富。分子变异方差分析结果显示99%的遗传变异来自种群内。群体间遗传分化系数(FST)为0.008,群体间分化程度较低。研究结果确定了广西不同区域糯玉米地方品种多态性及亲缘关系,为广西糯玉米种质改良和指导新品种培育提供理论依据。关键词:糯玉米;地方品种;遗传多样性;SNP标记ExploringtheGeneticDiversityandPopulationStructureofGuangxiWaxyMaizeLandracesBasedonSNPMarkersFANJing-sheng1,XIEHe-xia2,XIEXiao-dong2,ZHOUHai-yu2,CHENGWei-dong2,QINLan-qiu2,JIANGYu-feng2(1GuangxiSubtropicalCropsResearchInstitute,Nanning530001;2InstituteofMaizeResearch,GuangxiAcademyofAgriculturalSciences/GuangxiSub-centerofNationalMaizeImprovementCenter,Nanning530007)Abstract:Inordertodissectelitewaxymaizegermplasmresourcesfromlandracesinmaizebreeding,thegeneticdiversity207Guangxiwaxymaizelandracesand6referencewaxyinbredlineswasanalyzedbygenome-widescanningbasedon10KSNPmarkers.Theresultsshowedthattheoverallgeneticdiversityofthispopulationwasrelativelyhigh,withanaverageexpectedheterozygosity(He)of0.31,observedheterozygosity(Ho)of0.23,andanaveragepolymorphicinformationcontent(PIC)of0.2...