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鉴定铁死亡相关基因作为狼疮性肾炎诊断生物标志物的研究_吴昱升.pdfVIP免费

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论著·基础研究鉴定铁死亡相关基因作为狼疮性肾炎诊断生物标志物的研究基金项目:国家自然科学基金(81860131,82060133);广西自然科学基金(2017GXNSFAA198288,2019GXNSFDA245004)作者简介:吴昱升,男,在读硕士研究生,研究方向:足细胞损伤与修复。E-mail:824596620@qq.com▲通信作者:林栩。E-mail:linyyfyy@163.com[本文引用格式]吴昱升,林栩,王蓉,等.鉴定铁死亡相关基因作为狼疮性肾炎诊断生物标志物的研究[J].右江医学,2023,51(1):6-14.吴昱升1,2,林栩1,2▲,王蓉1,2,黄慕源1,2,徐璐瑶1,2,张洁1,2,杨岚茵1,2,蓝梦麟1,2(1.右江民族医学院附属医院肾内科,广西百色533000;2.广西免疫相关性疾病医学科研基础保障重点实验室,广西百色533000)【摘要】目的以铁死亡相关基因(ferroptosis-relatedgenes,FRGs)为目的基因筛选狼疮性肾炎(lupusnephritis,LN)的生物标志物。方法分别从基因表达数据库和FerrDB数据库下载LN相关数据和FRGs。接着使用差异表达分析、加权基因共表达网络分析(weightedgeneco-expressionnetworkanalysis,WGCNA)、LASSO(leastabsoluteshrinkageandselectionoperator)回归和支持向量机递归特征消除筛选关键基因,并绘制受试者工作特征(receiveroperatingcharacteristic,ROC)曲线评估关键基因的诊断能力,并验证诊断基因的表达量。结果本研究鉴定出2个关键基因(PTEN和NR4A1),关键基因的ROC曲线下面积均大于0.79,且PTEN在LN样本中高表达,NR4A1在LN样本中低表达。结论PTEN和NR4A1的发现为LN铁死亡相关研究提供了新的视角。【关键词】狼疮性肾炎;铁死亡;生物标志物;诊断基因中图分类号:R593.24+2文献标志码:ADOI:10.3969/j.issn.1003-1383.2023.01.002Astudyonidentificationofferroptosis-associatedgenesasdiagnosticbiomarkersforlupusnephritisWUYusheng1,2,LINXu1,2▲,WANGRong1,2,HUANGMuyuan1,2,XULuyao1,2,ZHANGJie1,2,YANGLanyin1,2,LANMenglin1,2(1.DepartmentofNephrology,AffiliatedHospitalofYoujiangMedicalUniversityforNationalities,Baise533000,Guangxi,China;2.GuangxiKeyLaboratoryofBasicGuaranteeforMedicalResearchofImmune-relatedDiseases,Baise533000,Guangxi,China)【Abstract】ObjectiveToscreenbiomarkersoflupusnephritis(LN)usingferroptosis-relatedgenes(FRGs)astargetgenes.MethodsLN-relateddataandFRGsweredow...

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