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基于网络药理学和生物信息学...胞的作用机制及实验验证研究_马旭东.pdfVIP免费

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海南医学2023年2月第34卷第4期HainanMedJ,Feb.2023.Vol.34,No.4基于网络药理学和生物信息学的黄杨碱抑制肾癌细胞的作用机制及实验验证研究马旭东1,2,杨进2,陈林2,吴波3,李嘉1,2,王威威1,2,梁国标11.遵义医科大学,贵州遵义563000;2.成都大学附属医院泌尿外科,四川成都610081;3.郫都区人民医院泌尿外科,四川成都611730【摘要】目的利用网络药理学和生物信息学研究黄杨碱(CVB-D)抑制肾癌细胞的作用机制,并通过人肾癌细胞系786-O,Caki-1进行体外实验验证相关预测结果。方法PharmMapper数据库检索CVB-D的作用靶点,DisGeNET数据库获得肾癌疾病靶点,通过venny平台整合CVB-D治疗肾癌的潜在靶点,将潜在靶点数据导入String数据库构建蛋白质-蛋白质互作网络(PPI),CytoScape软件可视化并修饰String数据,并用CytoHubba插件进一步分析网络中的Hub基因,得到的Hub基因用TCGA数据库作表达差异及生存分析。此外再用CVB-D与肾癌的交叉靶点数据进行GO和KEGG富集分析,得到CVB-D治疗肾癌潜在靶点的分子功能及相关作用信号通路等分析结果。最后采用CCK-8、克隆形成、细胞形态实验、流式细胞术、Westernblot实验验证CVB-D对肾癌的作用。结果分析得到CVB-D潜在作用靶点136个,疾病作用靶点2085个,CVB-D治疗肾癌的预测作用靶点68个,核心靶点5个。靶点共涉及生物过程238种,细胞组成30种,分子功能59种,以及参与肿瘤、PI3K-AKT、前列腺癌等细胞信号通路222条。CCK-8、克隆形成、细胞形态体外实验结果表明,CVB-D能显著抑制肾癌细胞的活力与增殖能力,呈浓度依赖性;流式细胞凋亡分析表明CVB-D能促进肾癌细胞凋亡,从而抑制肾癌细胞;Westernblot实验表明CVB-D作用后细胞中EGFR、p-PI3K、p-AKT相对表达水平降低,呈浓度依赖性。结论黄杨碱可能通过EGFR靶点和PI3K-AKT信号通路诱导人肾癌细胞凋亡,从而在肾细胞癌的治疗中发挥重要作用。【关键词】网络药理学;生物信息学;黄杨碱;肾细胞癌;表皮生长因子受体;PI3K-AKT通路【中图分类号】R737.11【文献标识码】A【文章编号】1003—6350(2023)04—0462—08MechanismandexperimentalverificationofCyclovirobuxineDininhibitingrenalcarcinomacellsbasedonnetworkpharmacologyandbioinformatics.MAXu-dong1,2,YANGJin2,CHENLin2,WUBo3,LIJia1,2,WANGWei-wei1,2,LIANGGuo-biao1.1.ZunyiMedicalUniversity,Zunyi563000,Guizhou,CHINA;2.DepartmentofUrology,AffiliatedHospitalofChengduUniversity,Che...

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