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贵州农业科学GuizhouAgriculturalSciences2023,51(3):66~72http://www.gznykx.org.cnDOI:10.3969/j.issn.1001-3601.2023.03.009收稿日期:2022-07-12基金项目:江西省双千计划基金项目(jxsq2019101057);江西省教育厅科技基金项目(GJJ190187)作者简介:胡嘉敏(2001—),女,在读本科,专业:农学。E-mail:949540894@qq.com*通讯作者:付海辉(1981—),男,副教授,博士,从事水稻、拟南芥、硅藻、线虫等模式生物生长发育和抗逆的基因转录后调控规律与分子机制研究。E-mail:fhh819@163.comOsa-miR1436靶标基因的生物信息学分析胡嘉敏,蒋鑫磊,刘少春,付海辉*(江西农业大学作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室,江西南昌330045)摘要:【目的】水稻稻瘟病感染过程0h、24h与48h的叶片miRNA进行高通量测序发现Osa-miR1436差异表达,探明miRNAs在水稻稻瘟病中的潜在功能,为Osa-miR1436在水稻稻瘟病发生中的功能与机理研究奠定分子基础。【方法】利用生物信息学软件psRNATarget对前期研究发现的1个miRNA表达水平发生显著变化的Osa-miR1436靶向基因进行预测,并对这些靶标基因进行GO、KEGG富集。【结果】通过预测发现70个靶标基因,这些基因主要富集在细胞大分子复合体组装(cellularmacromolecularcomplexas-sembly)、DNA复制(DNAreplication)、细胞应激反应(cellularresponsetostress)等与水稻抗逆相关生物学过程。靶标基因均显著富集了3种motif,且motif数量呈motif1>motif2>motif3。【结论】Osa-miR1436可能通过靶向抗逆相关基因调控水稻稻瘟病的发生。关键词:Osa-miR1436;水稻;靶标基因;生物信息学;抗逆;稻瘟病中图分类号:S431.11文献标识码:A文章编号:1001-3601(2023)03-0042-0066-07BioinformaticsAnalysisofOsa-miR1436TargetGeneHUJiamin,JIANGXinlei...

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