第14卷第2期食品安全质量检测学报Vol.14No.22023年1月JournalofFoodSafetyandQualityJan.,2023基金项目:国家重点研发计划项目(2019YFE0106600)Fund:SupportedbytheNationalKeyResearchandDevelopmentPlanofChina(2019YFE0106600)*通信作者:高中山,博士,教授,主要研究方向为过敏原分子基础和诊断应用。E-mail:gaozhongshan@zju.edu.cn*Correspondingauthor:GAOZhong-Shan,Ph.D,Professor,CollegeofAgricultureandBiotechnology,ZhejiangUniversity,Hangzhou310058,China.E-mail:gaozhongshan@zju.edu.cn过敏原综合数据库COMPARE的介绍和应用赵岚1,高中山1,2*(1.浙江大学农业与生物技术学院,杭州310058;2.浙江大学医学院过敏研究中心,杭州310058)摘要:随着分子生物学和基因组、蛋白组学技术的高速发展,越来越多的过敏原蛋白得到鉴定。为了提高对过敏原的研究及其在食品安全上的应用,很多机构都建立了不同类型的过敏原数据库。本文详细介绍了由美国健康与环境科学研究所(HealthandEnvironmentalSciencesInstitute,HESI)协调组织国际合作团队建立的一个过敏原综合数据库COMPARE(COMprehensiveProteinAllergenREsource),该数据库通过高通量序列分选算法结合专家人工审核方法,从各个公共蛋白质数据库、其他过敏原数据库以及相关文献中筛选过敏原,每年更新一次。此外还开发了基于FASTA算法的序列比对工具COMPASS(COMPareAnalysisofSequenceswithSoftware),允许用户进行实时序列比对。该数据库已广泛应用于新过敏原蛋白的鉴定以及蛋白质潜在致敏性的评价,对于食品安全管理和保障有重要参考价值。本文通过对COMPARE数据库的全面介绍,旨在提高该数据库在我国的应用价值,推动过敏原分子生物信息学的研究以及食品安全的发展。关键词:过敏原;数据库;COMPARE;生物信息学;序列比对;交叉反应;食品安全IntroductionandapplicationoftheCOMPAREallergendatabaseZHAOLan1,GAOZhong-Shan1,2*(1.CollegeofAgricultureandBiotechnology,ZhejiangUniversity,Hangzhou310058,China;2.AllergyResearchCenter,SchoolofMedicine,ZhejiangUniversity,Hangzhou310058,China)ABSTRACT:Withthedevelopmentofmolecularbiologyandgenomesandproteomictechnologies,moreandmoreallergencomponentshavebeenidentified.Inordertoimprovetheefficiencyoftheresearchandtheapplicationinthefoodsafety,severalinstitutionshaveestablishedvarioustypesofallergendatabases.Thisstudyintrod...
