第46卷第1期2023年1月河北农业大学学报JOURNALOFHEBEIAGRICULTURALUNIVERSITYVol.46No.1Jan.2023核桃JrOFP基因家族鉴定及其响应冷胁迫基因的转录表达分析刘凯1，李洋1，纪莲莲1，林娜1，王红霞2，王梦娜1，王娇1，孔祥文1（1.滨州职业学院，山东滨州，256603；2.河北农业大学园艺学院，河北保定071001）摘要：OFP(OVATEFamilyProtein)在植物调控响应逆境过程有重要作用。本研究基于核桃全基因组数据对其OPF基因家族成员进行筛选鉴定，并对其成员结构进行生物信息分析，同时对该家族成员进行时空转录水平分析。结果表明，核桃OFP基因家族包含21个成员，编码21条蛋白，均为亲水性蛋白；均含有典型的DUF623结构域；系统进化发现，该基因家族成员分为4个亚组。冷胁迫后经转录组分析，21个成员对冷胁迫均具有不同程度的响应，并在不同组织中存在特异性表达。本研究为进一步解析核桃OPF基因家族成员在响应冷胁迫过程中的分子机制提供了理论支撑。关键词：核桃；冷胁迫；OPF基因家族；转录分析中图分类号：S664.1开放科学（资源服务）标识码（OSID）：文献标志码：AIdentificationandtranscriptionalanalysisofJrOFPgenefamilyinresponsetochillingstressinwalnutLIUKai1,LIYang1,JILianlian1,LINNa1,WANGHongxia2,WANGMengna1,WANGJiao1,KONGXiangwen1(1.BinZhouPolytechnic,Binzhou,256603,China;2.CollegeofHorticulture,HebeiAgriculturalUniversity,Baoding071001,China)Abstract:OFPplaysanimportantroleinplantregulationandresponsetostressinthisstudy,themembersoftheOFPgenefamilywerescreenedoutofthewholegenomeofwalnut,andthebioinformaticsanalysisofthestructureofthememberswascarriedout.Atthesametime,thetranscriptionlevelsofthefamilymemberswereanalyzedundercoldstressatdifferenttimesandindifferenttissues.TheresultsshowedthatthewalnutOFPgenefamilycontained21members,encoding21proteins,thatwereallhydrophilic.TheproteinsallcontainedatypicalDUF623domain.Themembersweredividedinto4subgroupsphylogenetically.Thetranscriptomedatashowedthat21membersrespondedtodifferentdegreesofcoldstressatdifferenttimes,andwereexpressedindifferenttissues.TheresultsofthisstudywillprovidetheoreticalsupportforfurtheranalysisofthemolecularmechanismofwalnutOPFgenefamilymembersinresponsetochillingstressandgrowth...
