清洗：1、清洗样品池先用蒸馏水将样品池表明冲洗干净，再用洗耳球将水吹出凹槽，用滤纸将旁边的水吸干2、清洗盖玻片先用镊子小心夹住，再用蒸馏水冲洗干净，然后用洗耳球将水吹到边缘，最后用滤纸吸干3、制备活酵母菌样本先量取约20mL蒸馏水倒进烧瓶中，再从活酵母菌小瓶轻嗑10几粒酵母菌入烧瓶中，摇匀后放入超声波清洗器中5分钟，中间最后再摇匀几次使酵母菌分散，便于观察4、放入样本将样品池放在显微镜架子上，滴入2滴活酵母菌溶液，小心用盖玻片盖上仪器操作：1、打开显微镜，然后打开激光源，以1mA/2s的速率增加激光功率（防止脉冲电流损坏仪器）。本实验采用的λ=780nm的近红外光，当激光器电流升至30-40mA，激光器出光，由于出射光波长有一定范围，所以为红光。2、激光器出光后打开CCD，CCD拍摄的是物镜上方的物体，由于没有装样品，仅调节显微镜亮度使CCD成像清晰。然后对准载物台中心孔与物镜垂直桌面。3、滴油。由于实验中的物镜有125mm的数值孔径，为了防止这段空气产生折射，需要在物镜上方滴半滴油，油的折射率与载玻片相同，所以不发生折射。滴油时切忌不要让滴油嘴碰到物镜或载玻片，也不可滴多。4、将洗好的样品放入载物台，调节载物台高度，使其刚好接触到油，这样避免了空气间隙。5、将配好的酵母溶液滴在样品池中，之后用镊子夹着盖玻片轻压在样品上，玻片厚度为0.17mm，操作时注意不要用力。6、将激光器电流缓慢从30mA升至70mA。7、用CCD观察酵母细胞。微调载物台的水平位置可以实现视野的移动，方便选择合适的酵母细胞。显微镜的上下微调，使光阱与酵母在同一水平面上。调节光束焦面，可看到会聚光斑即为光阱所在，然后将平面上移5μm，此时可捕获到酵母细胞。整理仪器：将样品池及盖玻片从架子上小心取出，盖玻片可以直接扔进垃圾桶里，样品池底面和显微镜头上面的油需要用棉签蘸取酒精，包裹着擦镜纸轻微滚动拭去(擦镜纸尽量节约，1/3足以，重复擦拭2-3次直至将油擦净)，最后用蒸馏水将样品池清洗干净，倒扣放入盒中。
