第33卷第1期2023年2月生物技术Biotechnology33(1):9Feb.,2023收稿日期:2022-05-09基金资助:国家自然科学基金项目(81900074)作者简介:丁文一(1983-),女,北京人,本科,技师,E-mail:dwy2311@gmail.com。∗通讯作者:安志远(1985-),男,硕士,主管技师,研究方向:鲍曼不动杆菌及其毒力因子与宿主免疫系统相互作用,发表中文核心期刊论文7篇、SCI文章3篇,E-mail:mran850712@aliyun.com。鲍曼不动杆菌感染HeLa细胞与YY1互作的差异蛋白鉴定丁文一1,安志远2∗(1.中国医学科学院北京协和医院检验科,北京100730;2.首都医科大学附属北京朝阳医院医学研究中心,北京100020)摘要:[目的]鉴定鲍曼不动杆菌感染HeLa细胞前后与YY1互作的差异蛋白。[方法]用脂质体转染法在HeLa细胞中过表达YY1;之后用Co-IP技术捕获与YY1相互作用的蛋白质;最后利用高效液相色谱质谱联用技术鉴定互作差异蛋白。用GO注释和KEGG分析预测蛋白质的功能。[结果]经Co-IP和蛋白银染发现鲍曼不动杆菌感染组和YY1捕获组与IgG组比较在45~55kDa和70~100kDa处有明显的差异条带;质谱结果显示YY1捕获组的特有蛋白有81个,GO注释和KEGG分析表明这些差异蛋白定位于细胞核及核膜,具有RNA结合功能,主要参与了RNA剪切的生物学过程;与IgG组和YY1捕获组比较在鲍曼不动杆菌感染组中获得了SFRS4、CPSF2、LUC7L2和U2AF65这些差异蛋白。GO注释和KEGG分析表明这些差异蛋白定位于细胞核散斑,具有RNA结合功能,主要参与了mRNA剪切和核输出的生物学过程。[结论]鲍曼不动杆菌感染的HeLa细胞中与YY1作用的蛋白均参与了RNA剪切过程,提示鲍曼不动杆菌很可能利用这些蛋白来调节YY1,为进一步研究鲍曼不动杆菌与YY1的相互作用机制奠定了基础。关键词:鲍曼不动杆菌;转录因子YY1;Co-IP/MS技术;HeLa细胞;生信分析中图分类号:378.99文献标识码:ADOI:10.16519/j.cnki.1004-311x.2023.01.0002IdentificationofdifferentialproteinsinteractingwithYY1inHeLacellsinfectedbyAcinetobacterbaumanniiDINGWen-yi1,ANZhi-yuan2∗(1.DepartmentofClinicalLaboratory,PekingUnionMedicalCollegeHospital,ChineseAcademyofMedicalSciences,Beijing100730,China;2.MedicalResearchCenter,BeijingChaoyangHospital,CapitalMedicalUniversity,Beijing100020,China)Abstract:[Objective]ToidentifythedifferentialproteinsinteractingwithYY1beforeandafterinfectionofHeLacellsbyAcinetobacterbaumannii.[Method]YY1wasoverexpressedinHeLacellsbylipofe...
